Alphacoronavirus -Alphacoronavirus

Alphacoronavirus
12985 2015421 Fig1 HTML.webp
Sian epidemian ripuliviruksen genomi ja virionirakenne
Virusten luokittelu e
(järjestämättä): Virus
Valtakunta : Riboviria
Kuningaskunta: Orthornavirae
Pylum: Pisuviricota
Luokka: Pisoniviricetes
Tilaus: Nidovirales
Perhe: Coronaviridae
Alaperhe: Ortokoronavirukset
Suku: Alphacoronavirus
Alalajit ja lajit

Katso teksti

Alphacoronaviruses (Alpha-CoV) ovat jäseniä ensimmäinen neljästä sukujen ( Alpha -, beeta- , Gamma , ja Deltapurge ) ja koronavirusten . Ne ovat positiivisen tunteen omaavia yksijuosteisia RNA-viruksia, jotka tartuttavat nisäkkäitä , myös ihmisiä . Niillä on pallomainen virionien kanssa maila muotoinen pinta ulokkeet on muodostettu trimeerit piikki proteiinin , ja viruksen vaipan .

Alphacoronaviruses ovat alaheimoon Orthocoronavirinae perheen Coronaviridaen . Sekä alfa- että betakoronaviruslinjat laskeutuvat lepakon virusgeenistä . Alphacoronavirus tunnettiin aiemmin nimellä " phylogroup 1 coronaviruses".

Etymologia

Nimi alphacoronavirus on peräisin antiikin kreikan ἄλφα ( Alpha , "ensimmäinen kirjain on kreikkalaisten aakkosten "), ja κορώνη (korṓnē ’Garland, seppele’), mikä tarkoittaa kruunu, joka kuvaa pinnan ulkonäkö ennusteiden alta näkyy elektronimikroskoopilla jotka muistuttavat aurinkokoronaa .

Rakenne

Virion on vaipallinen ja pallomainen, halkaisijaltaan 120–160 nm ja ydinkuori noin 65 nm. Glykoproteiinit ja trimmerit muodostavat suuria pinnan ulokkeita, jotka luovat auringon koronan ulkonäön. Tällä suvulla, kuten muillakin koronaviruksilla, on piikkiproteiini, jossa on tyypin I fuusiokone (S2) ja reseptoria sitova domeeni (S1). Se kokoontuu trimeeriksi. Toisin kuin beeta- ja gammakoronavirukset, tämä proteiini ei jakaudu kahteen osaan.

Perimä

Geneettiset suhteet kissan eri koronavirusten (FCov) ja koirien koronavirusten (CCoV) genotyyppien välillä. Yhdistelmä nuolilla.

Genomi on positiivisen tunteen omaava yksijuosteinen RNA, jonka pituus on 27-29 kilobassiä ja 3'-polyA-häntä. Kaksi suurta, päällekkäisiä ORF: 5'-genomin loppuun koodaavat merkittäviä ei-rakenteellisia proteiineja ilmaistuna fuusioproteiinin mukaan ribosomaalisen lukukehyksen . Näitä ovat alueet, joissa on proteaasi- , helikaasi- ja RNA -polymeraasimotiiveja. Alavirrassa on seitsemän muuta geeniä, jotka koodaavat rakenneproteiineja. Nämä ekspressoidaan 3'-koterminaalisesta sisäkkäisistä subgenomisista mRNA -sarjoista .

Yhdistelmä

Molempien alfacoronavirus 1 -tyyppien , kissan koronaviruksen (FCoV) ja koirien koronaviruksen (CCoV), tiedetään esiintyvän kahdessa serotyypissä. Serotyyppi II kohdistaa Aminopeptidaasi N: n , kun taas serotyypin I reseptori on tuntematon. Ero johtuu erilaisesta piikkiproteiinista. FCoV: lle ja CCoV: lle on yhteinen esi -isä. Tämä esi -isä kehittyi vähitellen FCoV I: ksi ja CCoV I: ksi. Tuntemattoman viruksen S -proteiini yhdistettiin esi -isään ja synnytti CCoV II: n. CCoV II yhdistettiin jälleen FCoV: n kanssa FCoV II: n luomiseksi. CCoV II kehittyi vähitellen TGEV: ksi. Piikin poisto TGEV: ssä luo PRCV: n. Kaikki nämä virukset lajitellaan alaryhmään Tegacovirus .

Luokittelu

Alphacoronaviruses -suvun filogeeninen puu, jossa isäntäeläimet on merkitty oikealle puolelle.

Seuraavat alalajit ja lajit tunnistetaan:

Katso myös

Viitteet

Ulkoiset linkit