Caulimoviridae -Caulimoviridae
Caulimoviridae | |
---|---|
Virusten luokittelu | |
(järjestämättä): | Virus |
Valtakunta : | Riboviria |
Kuningaskunta: | Pararnavirae |
Pylum: | Artverviricota |
Luokka: | Revtraviricetes |
Tilaus: | Ortervirales |
Perhe: | Caulimoviridae |
Caulimoviridae onkasveja tartuttavien virusten perhe. Tähän perheeseen kuuluu 94 lajia, jotka on luokiteltu 11 sukuun. Caulimoviridae- heimoon kuuluvia viruksiakutsutaan kaksijuosteiseksi DNA: ksi (dsDNA) käänteiskopioiviksi viruksiksi (tai pararetroviruksiksi) eli viruksiksi, jotka sisältävät käänteiskopiointivaiheen replikaatiosyklissä. Tämä perhe sisältää kaikkidsDNA -genomin omaavat kasvivirukset , joiden elinkaarissa on käänteiskopiointivaihe.
Taksonomia
Seuraavat suvut tunnustetaan:
- Badnavirus
- Caulimovirus
- Cavemovirus
- Dioskovirus
- Petuvirus
- Rosadnavirus
- Ruflodivirus
- Solendovirus
- Soymovirus
- Tungrovirus
- Rokotevirus
Viruksen hiukkasrakenne
Kaikki tämän perheen virukset ovat vaipattomia. Virushiukkaset ovat joko bakteeri- tai isometrisiä. Virusrakenteeseen sisällytetty nukleokapsidin tyyppi määrittää viruspartikkelien koon. Bacilliform -hiukkaset ovat halkaisijaltaan noin 35–50 nm ja jopa 900 nm pitkiä. Isometristen hiukkasten halkaisija on keskimäärin 45–50 nm ja niillä on ikosaedrinen symmetria.
Genomin rakenne ja replikaatio
Tämän perheen virusten genomit sisältävät yksipartiittisen, ei-kovalenttisesti suljetun pyöreän dsDNA: n, jonka koko on 7,2–9,3 kbp, ja epäjatkuvuuksia molemmissa genomiketjuissa tietyissä paikoissa. Nämä genomit sisältävät yhden avoimen lukukehyksen (ORF), kuten havaittiin petuviruksissa , kahdeksaan ORF: ään, kuten soymoviruksiin . Viruksen genomien koodaamia proteiineja ovat käänteiskopioijaentsyymi -ribonukleaasi H, asparagiiniproteaasit , nukleokapsidit ja transaktivaattorit.
Replikointi tapahtuu sekä sytoplasmassa että isäntäsolujen ytimessä. Ensinnäkin viruksen genomi tulee sytoplasmaan . Viruksen DNA muodostaa superkelatut minikromosomirakenteet tullessaan isäntäytimeen, missä se transkriboidaan polyadenyloituun RNA: han, joka on lopulta redundantti (johtuen transkriptiosta, joka esiintyy kahdesti joillekin DNA-osille). Äskettäin transkriptoitu RNA tulee sytoplasmaan, jossa se joko käännetään virusproteiineiksi tai viruksen käänteiskopioijakirjoituksella transkriptoidaan uudelleen uusiin kopioihin dsDNA -virusgenomista . Uudet dsDNA -genomit kapseloidaan sytoplasmaan ja vapautetaan.
Replikointiprosessi sisältää retro-transkriptiovaiheen ja RNA-välituotteen, joten Caulimoviridae- perheen viruksia ei pidetä todellisina dsDNA- viruksina- sen sijaan niitä kutsutaan DNA-käänteiskopioiviksi viruksiksi. Heillä on tämä ominaisuus retrovirusten kanssa . Kuitenkin, toisin kuin retrovirukset, virusten perheen Caulimoviridae eivät vaadi integroitumista viruksen genomiin isäntiensä jotta replikoitua ja tästä syystä niiden genomiin ei koodaa entsymaattisen proteiinin integraasin .
Endogeenisten viruselementtien (EVE) esiintyminen kasvien genomeissa on yleistä. ja tunnetuimmat kasvien EVE: t ovat peräisin viruksista, joilla on Caulimoviridae -perheen DNA -genomeja . Integraation uskotaan tapahtuvan ei-homologisen loppuliitoksen (laittoman rekombinaation) kautta DNA-korjausmekanismien aikana. Useimmat kasvien EVE: t eivät ole tarttuvia. Kuitenkin tarttuvia Caulimoviridae EVE: itä on raportoitu petunian ( Petunia -laskimoiden puhdistusvirus ), banaanin ( Banana -putki OL -virus , Banana Streak GF -virus , Banana Streak IM -virus) ja Nicotiana edwardsonii ( Tupakan laskimoiden puhdistusvirus ) genomissa .
Viitteet
Ulkoiset linkit
- ICTV -raportti: Caulimoviridae
- "Caulimoviridae" . Viralzone.
- Spumavirus Yhdysvaltain kansallisessa lääketieteen kirjastossa Medical Subject Headings (MeSH)
- "Caulimoviridae" . NCBI -taksonomiaselain . 186534.