Coronaviridae -Coronaviridae
Coronaviridae | |
---|---|
Kaavio, elektronimikroskooppikuvassa , ja genomi koronaviruksen tyyppejä . | |
Virusten luokittelu | |
(järjestämättä): | Virus |
Valtakunta : | Riboviria |
Kuningaskunta: | Orthornavirae |
Pylum: | Pisuviricota |
Luokka: | Pisoniviricetes |
Tilaus: | Nidovirales |
Alitilaus: | Cornidovirineae |
Perhe: | Coronaviridae |
Alaperheet ja suvut | |
Coronaviridae on vaipallisten , positiivisen juosteen RNA-virusten perhe ,joka tartuttaa sammakkoeläimiä , lintuja ja nisäkkäitä . Ryhmään kuuluvat Letovirinae- ja Orthocoronavirinae -alaperheet ; jälkimmäisten jäsenet tunnetaan koronaviruksina .
Viruksen genomin pituus on 26–32 kilobaasia . Hiukkaset on tyypillisesti koristeltu suurilla (~ 20 nm), mailan tai terälehden muotoisilla pinnan ulokkeilla (" peplomeerit " tai "piikit"), jotka pallomaisten hiukkasten elektronimikrokuvissa luovat auringon koronan muistuttavan kuvan .
Virologia
Genomin 5'- ja 3' -päissä on korkki ja vastaavasti poly (A) -kanava . Viruksen vaippa , joka on saatu orastava kalvojen läpi ja endoplasmakalvoston (ER) tai Golgin laitteeseen , sisältää aina kaksi virusspesifioitujen (glyko) proteiinia lajit, S ja M. Glykoproteiini S käsittää suuren pinta-ulokkeet, kun taas M on kolmi- kalvon läpäisevä proteiini. Toroviruksilla ja tietyllä koronavirusten alaryhmällä (erityisesti B- alakoronaviruksen suvun A-alaryhmän jäsenillä ) on S- peplomeerien lisäksi toisen tyyppinen pintaprojektio, joka koostuu hemagglutiniiniesteraasiproteiinista. Toinen tärkeä rakenteellinen proteiini on fosfoproteiini N, joka vastaa kierteisen symmetria nukleokapsidin, joka sulkee sisäänsä genomisen RNA: n.
Geneettinen rekombinaatio voi tapahtua, kun vähintään kaksi virusgenomia on läsnä samassa tartunnan saaneessa isäntäsolussa. RNA: n rekombinaatio näyttää olevan merkittävä liikkeellepaneva voima koronaviruksen evoluutiossa. Rekombinaatio voi määrittää geneettisen vaihtelun CoV -lajin sisällä, CoV -lajin kyvyn hypätä isännältä toiselle ja harvoin uuden CoV: n syntymisen. CoV: n rekombinaation tarkka mekanismi ei ole tiedossa, mutta siihen liittyy todennäköisesti templaatin vaihto genomin replikaation aikana.
Taksonomia
Coronaviridae- perhe on jaettu kahteen alaryhmään, 5 sukuun, 26 alalajiin ja 46 lajiin. Muut lajit ovat vireillä tai alustavia.
- Coronaviridae
Koronavirus on yleinen nimi koronaviruksille ja ortokoronavirille , joita kutsutaan myös koronaviruksiksi . Koronavirukset aiheuttavat sairauksia nisäkkäillä ja linnuilla. Ihmisillä virukset aiheuttavat hengitystieinfektioita , mukaan lukien flunssa , jotka ovat tyypillisesti lieviä, mutta harvinaisemmat muodot, kuten SARS (mukaan lukien COVID-19: n aiheuttava ) ja MERS, voivat olla tappavia. Oireet vaihtelevat muilla lajeilla: kanoilla ne aiheuttavat ylähengitysteiden sairauden, kun taas lehmillä ja sioilla koronavirus aiheuttaa ripulia. Lukuun ottamatta SARS-CoV-2: ta ei ole rokotteita tai viruslääkkeitä ihmisen koronavirusinfektioiden ehkäisemiseksi tai hoitamiseksi. Ne ovat vaipallisia viruksia, joilla on positiivisen tunteen yksijuosteinen RNA- genomi ja kierukkasymmetrian nukleokapsidi . Genomin koko koronavirusten vaihtelee noin 26-32 kiloemästä , suurimpia varten RNA-virus (toinen vain 41 kb nidovirus äskettäin löydettiin planaria ).
-
Ortokoronavirukset
- Alphacoronavirus
- Betakoronavirus
- Gammacoronavirus
- Deltakoronavirus