KCNA4 - KCNA4
Kaliumkanavan Kv1.4 -tandem -inaktivointialue | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Tunnisteet | |||||||||
Symboli | K_kanava_TID | ||||||||
Pfam | PF07941 | ||||||||
InterPro | IPR012897 | ||||||||
SCOP2 | 1kn7 / SCOPe / SUFFAM | ||||||||
|
Kaliumjänniteportainen kanavan alaperhe Jäsen 4, joka tunnetaan myös nimellä K v 1.4, on proteiini, jota ihmisillä koodaa KCNA4- geeni . Se edistää sydämen tilapäinen kaliumin virtausta ulospäin (I to1 ), tärkein myötävaikuttavat virran repolaroivien vaihe 1 sydämen aktiopotentiaalin .
Kuvaus
Kaliumkanavat edustavat jännittävimpien ionikanavien monimutkaisinta luokkaa sekä toiminnallisesti että rakenteellisesti. Niiden monipuolisiin toimintoihin kuuluu välittäjäaineiden vapautumisen, sykkeen, insuliinin erityksen, hermosolujen herkkyyden, epiteelin elektrolyyttien kuljetuksen, sileiden lihasten supistumisen ja solutilavuuden säätely. Drosophilassa on tunnistettu neljä sekvenssiin liittyvää kaliumkanavageeniä - shaker, shaw, shab ja shal - ja jokaisella on osoitettu olevan ihmisen homologeja. Tämä geeni koodaa kaliumkanavan jäsentä, jännitettä, shakeriin liittyvää alaperhettä. Tämä jäsen sisältää kuusi kalvoa kattavaa verkkotunnusta, joissa on shaker-tyyppinen toisto neljännessä segmentissä. Se kuuluu A-tyypin kaliumvirraluokkaan, jonka jäsenet voivat olla tärkeitä sydämen toimintapotentiaalien nopean repolarisaatiovaiheen säätelyssä ja voivat siten vaikuttaa sydämen toimintapotentiaalin kestoon. Tämän geenin koodaava alue on introniton, ja geeni on ryhmitelty geeneihin KCNA3 ja KCNA10 kromosomissa 1 ihmisillä.
KCNA4 (Kv1.4) sisältää tandem -inaktivointidomeenin N -päässä . Se koostuu kahdesta aliverkkotunnuksesta. Inaktivointidomeeni 1 (ID1, tähteet 1-38) koostuu joustavasta N-päästä, joka on ankkuroitu 5-kierroksiseen kierukkaan , ja sen uskotaan toimivan sulkemalla ionireitti, kuten klassisen pallodomeenin tapauksessa. Inaktivointidomeeni 2 (ID2, tähteet 40-50) on 2,5-kierroksinen kierre, jossa on suuri osuus hydrofobisia tähteitä ja joka todennäköisesti palvelee ID1: n kiinnittämistä kanavan sytoplasmaan . Tällä tavalla se voi edistää ID1: n nopeaa pääsyä avoimen kanavan reseptorikohtaan. ID1 ja ID2 toimivat yhdessä saadakseen aikaan Kv1.4-kanavan nopean inaktivoinnin, mikä on tärkeää kanavan roolille lyhytaikaisessa plastisuudessa.
Vuorovaikutukset
KCNA4 on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa kanssa DLG4 , KCNA2 ja DLG1 .
Katso myös
Viitteet
Lue lisää
- Scott HS, Litjens T, Hopwood JJ, Morris CP (marraskuu 1992). "Kahden RFLP: n PCR-havaitseminen alfa-L-iduronidaasi (IDUA) -geenin eksonissa I". Ihmisen genetiikka . 90 (3): 327. doi : 10.1007/bf00220095 . PMID 1362562 . S2CID 22700269 .
- Gessler M, ryhmä A, Grzeschik KH, Pongs O (marraskuu 1992). "Kaliumkanavageeni HK1 kartoittaa ihmisen kromosomin 11p14.1, lähellä FSHB -geeniä" . Ihmisen genetiikka . 90 (3): 319–21. doi : 10.1007/bf00220091 . PMID 1487251 . S2CID 10237322 .
- Philipson LH, Hice RE, Schaefer K, LaMendola J, Bell GI, Nelson DJ, Steiner DF (tammikuu 1991). "Ihmisen insulinooman ja saarekekaliumkanavan sekvenssi ja toiminnallinen ilmentyminen Xenopus -munasoluissa" . Yhdysvaltain kansallisen tiedeakatemian julkaisut . 88 (1): 53–7. Bibcode : 1991PNAS ... 88 ... 53P . doi : 10.1073/pnas.88.1.53 . PMC 50746 . PMID 1986382 .
- Tamkun MM, Knoth KM, Walbridge JA, Kroemer H, Roden DM, Glover DM (maaliskuu 1991). "Kahden jännite-aidatun K+ -kanavan cDNA: n molekyylikloonaus ja karakterisointi ihmisen kammiosta". FASEB -lehti . 5 (3): 331–7. doi : 10.1096/fasebj.5.3.2001794 . PMID 2001794 . S2CID 23737559 .
- Kim E, Niethammer M, Rothschild A, Jan YN, Sheng M (marraskuu 1995). "Shaker-tyyppisten K+ -kanavien klusterointi vuorovaikutuksessa kalvoon liittyvien guanylaattikinaasiperheiden kanssa" . Luonto . 378 (6552): 85–8. Bibcode : 1995Natur.378 ... 85k . doi : 10.1038/378085a0 . PMID 7477295 . S2CID 4362906 .
- Klocke R, Roberds SL, Tamkun MM, Gronemeier M, Augustin A, Albrecht B, et ai. (Joulukuu 1993). "Kromosomikartoitus hiirissä kahdeksasta K (+)-kanavageenistä, jotka edustavat neljää Shakerin kaltaista alaperhettä Shaker, Shab, Shaw ja Shal". Genomiikka . 18 (3): 568–74. doi : 10.1016/S0888-7543 (05) 80358-1 . PMID 7905852 .
- Philipson LH, Eddy RL, näyttää TB, Bell GI (helmikuu 1993). "Ihmisen kaliumkanavageenin KCNA4 (Kv1.4, PCN2) osoittaminen kromosomiin 11q13.4-> q14.1". Genomiikka . 15 (2): 463–4. doi : 10.1006/geno.1993.1094 . PMID 8449523 .
- Niethammer M, Kim E, Sheng M (huhtikuu 1996). "Vuorovaikutus NMDA-reseptorin alayksiköiden C-pään ja kalvoon liittyvien guanylaattikinaasien PSD-95-perheen useiden jäsenten välillä" . Journal of Neuroscience . 16 (7): 2157–63. doi : 10.1523/JNEUROSCI.16-07-02157.1996 . PMC 6578538 . PMID 8601796 .
- Kim E, Sheng M (1997). "PSD-95: n ja SAP97: n, kahden kalvoon liittyvän oletetun guanylaattikinaasin, differentiaalinen K+ -kanavan klusterointiaktiivisuus" . Neurofarmakologia . 35 (7): 993–1000. doi : 10.1016/0028-3908 (96) 00093-7 . PMID 8938729 . S2CID 23755452 .
- Kim E, Naisbitt S, Hsueh YP, Rao A, Rothschild A, Craig AM, Sheng M (helmikuu 1997). "GKAP, uusi synaptinen proteiini, joka on vuorovaikutuksessa kanavan klusteroivien molekyylien PSD-95/SAP90-perheen guanylaattikinaasimaisen domeenin kanssa" . Journal of Cell Biology . 136 (3): 669–78. doi : 10.1083/jcb.136.3.669 . PMC 2134290 . PMID 9024696 .
- Niethammer M, Valtschanoff JG, Kapoor TM, Allison DW, Weinberg RJ, Craig AM, Sheng M (huhtikuu 1998). "CRIPT, uusi postsynaptinen proteiini, joka sitoutuu PSD-95/SAP90: n kolmanteen PDZ-domeeniin". Neuron . 20 (4): 693–707. doi : 10.1016/S0896-6273 (00) 81009-0 . PMID 9581762 . S2CID 16068361 .
- Brenman JE, Topinka JR, Cooper EC, McGee AW, Rosen J, Milroy T, et ai. (Marraskuu 1998). "Postsynaptisen tiheyden 93 lokalisointi dendriittisiin mikrotubuluksiin ja vuorovaikutus mikrotubuluksiin liittyvän proteiinin 1A kanssa" . Journal of Neuroscience . 18 (21): 8805–13. doi : 10.1523/JNEUROSCI.18-21-08805.1998 . PMC 6793550 . PMID 9786987 .
- Coleman SK, Newcombe J, Pryke J, Dolly JO (elokuu 1999). "Kv1 -kanavien alayksikkökoostumus ihmisen keskushermostossa" . Journal of Neurochemistry . 73 (2): 849–58. doi : 10.1046/j.1471-4159.1999.0730849.x . PMID 10428084 . S2CID 20632070 .
- D'Adamo MC, Imbrici P, Sponcichetti F, Pessia M (elokuu 1999). "KCNA1-geenin mutaatiot, jotka liittyvät episodiseen ataksia-tyypin 1 oireyhtymään, heikentävät heteromeeristä jänniteportaista K (+) -kanavan toimintaa". FASEB -lehti . 13 (11): 1335–45. doi : 10.1096/fasebj.13.11.1335 . PMID 10428758 . S2CID 12876970 .
- Hogan A, Shepherd L, Chabot J, Quenneville S, Prescott SM, Topham MK, Gee SH (heinäkuu 2001). "Gamma 1-syntrofiinin vuorovaikutus diasyyliglyserolikinaasi-zeta: n kanssa. Ydinpaikannuksen säätely PDZ-vuorovaikutusten avulla" . Journal of Biological Chemistry . 276 (28): 26526–33. doi : 10.1074/jbc.M104156200 . PMID 11352924 .
- Cukovic D, Lu GW, Wible B, Steele DF, Fedida D (kesäkuu 2001). "Kv1.5- ja Kv1.4-kaliumkanavien erillinen aminoterminaalinen domeeni on vuorovaikutuksessa alfa-aktiniini-2: n spektri-toistojen kanssa" . FEBS -kirjeet . 498 (1): 87–92. doi : 10.1016/S0014-5793 (01) 02505-4 . PMID 11389904 . S2CID 20622483 .
- Imamura F, Maeda S, Doi T, Fujiyoshi Y (helmikuu 2002). "Toisen PDZ-alueen ligandin sitoutuminen säätelee PSD-95: n klusterointia Kv1.4-kaliumkanavan kanssa" . Journal of Biological Chemistry . 277 (5): 3640–6. doi : 10.1074/jbc.M106940200 . PMID 11723117 .
- Piserchio A, Pellegrini M, Mehta S, Blackman SM, Garcia EP, Marshall J, Mierke DF (maaliskuu 2002). "SAP90: n PDZ1 -alue. Rakenteen ja sitoutumisen karakterisointi" . Journal of Biological Chemistry . 277 (9): 6967-73. doi : 10.1074/jbc.M109453200 . PMID 11744724 .
Ulkoiset linkit
- Kv1.4 + Kalium + Kanava on Yhdysvaltain National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- KCNA4 + proteiini + ihmisen on Yhdysvaltain National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- Yleiskatsaus kaikista ATE : ssä saatavilla olevista rakenteellisista tiedoista UniProtille : P15385 (Rat Potassium -jänniteportoitu kanavan alaperheen A jäsen 4) PDBe-KB: ssä .
Tämä artikkeli sisältää Yhdysvaltain kansallisen lääketieteen kirjaston tekstiä , joka on julkisesti saatavilla .