Megavirus - Megavirus

Katso myös: Giant virus

Megavirus
Megavirus.jpg
Virusten luokittelu
Ryhmä:
Ryhmä I ( dsDNA )
(järjestämättä):
Nukleosytoplasmiset suuret DNA -virukset
Perhe:
Megaviridae
Suku:
Megavirus
Laji

Megavirus chilensis

Megavirus on viruksen suku, joka sisältää yhden määritellyssä laji nimeltään Megavirus chilensis , jotka liittyvät fylogeneettisesti Acanthamoeba polyphaga mimivirus (APMV). Puhekielessä Megavirus chilensistä käytetään yleisemmin nimitystä "Megavirus". Kunnes löytö pandoraviruses vuonna 2013, se oli suurin kapsidi halkaisija kaikkien tunnettujen virusten, samoin kuin suurin ja monimutkaisin genomin kaikkien tunnettujen virusten varalta.

Löytö

Megavirus eristettiin vesinäytteestä, joka kerättiin huhtikuussa 2010 Chilen rannikolta , lähellä Las Crucesin meriasemaa. -Marseillen yliopisto). Tämän laboratorion tutkijat olivat jo mukana Mimiviruksen, ensimmäisen kuvatun jättiläisen T2 -viruksen, karakterisoinnissa. Megavirus eristettiin niitä viljeltiin erilaisia Acanthamoeba laboratoriokantaa ( A. polyphaga , A. castellaniista , A. Griffini ) seuraava protokolla edelläkävijä Dr. Timothy Rowbotham eristämiseksi solunsisäisten loisten bakteerit. Megavirus tartuttaa amoeboja.

Luokitus

Kansainvälinen virusten taksonomiakomitea ei ole vielä luokitellut megavirusta , mutta sitä ehdotetaan Megaviridae -perheen jäseneksi, joka on uusi perhe, joka koostuu suurista DNA -viruksista, joiden genomi on noin miljoona emäsparia pitkä. Tämän uuden perheen jäsenet, jotka on määritelty useilla yhteisillä erityispiirteillä (taulukko 1 ja 2), sisältävät erilaisia ​​viruksia, joilla on todennäköisesti yhteinen esi -isä Mimiviruksen ja Megaviruksen kanssa, vaikka niiden nykyinen genomikoko pieneni alle 1 Mt. Megavirus liittyy myös joukkoon suuria viruksia, jotka tunnetaan nukleosytoplasmisina suurina DNA -viruksina (NCLDV), vaikka tämä termi näyttää yhä sopimattomammalta nimetä viruksia, jotka replikoituvat kokonaan isäntiensä sytoplasmassa suurien virionitehtaiden de novo -synteesin kautta. Megaviruksella ja Mimiviruksella on 594 ortologista geeniä, jotka sijaitsevat enimmäkseen niiden genomien keskisegmentissä. Aminohapposekvenssitasolla vastaavilla proteiineilla on keskimäärin 50% identtisiä tähteitä.

Rakenne

Megavirus partikkeli osoittaa proteiinin kapsidin halkaisija on 440 nanometriä (kuten nähdään elektronimikroskoopilla on ohuita leikkeitä epoksihartsia sulkeumat), suljettu kiinteään mesh bakteeri-kaltainen kapselisakkaridi materiaali 75 nm 100 nm. Kapsiidi näyttää kuusikulmaiselta, mutta sen ikosaedrinen symmetria on epätäydellinen, koska tähtiportti on läsnä yksittäisessä ikosaedrin kärjessä. Tähtiportti on viisiosainen tähtirakenne, joka muodostaa portaalin, jonka kautta hiukkasen sisäydin toimitetaan isännän sytoplasmaan. Tämä ydin on suljettu hiukkasen kahteen lipidikalvoon, ja se sisältää myös suuren ja monipuolisen virusproteiinikompleksin (esim. Kaikki transkriptionaaliset kompleksit). Yllättäen megavirus on suurempi kuin jotkut bakteerit.

Perimä

Megavirus chilensis -genomi on lineaarinen, kaksijuosteinen DNA -molekyyli, jonka pituus on 1 259 197 emäsparia . Tämä tekee siitä toiseksi suurimman tähän mennessä puretun virusgenomin ( Pandoraviridaen jälkeen ), ylittäen Mamaviruksen seuraavaksi suurimman virusgenomin 67,5 kb: lla. Ennen sen transkriptin validointia sen ennustetaan koodaavan 1120 proteiinia koodaavaa geeniä, mikä on lukuisasti suurempi kuin monien bakteerien osoittama luku.

Kuitenkin vähitellen koon muutoksen lisäksi Megavirus -genomissa on 7 aminoasyyli -tRNA -syntetaasia (taulukko 2). Vaikka 4 näistä entsyymeistä tiedettiin olevan läsnä mimiviruksessa ja mamaviruksessa (tyrosiinille, arginiinille, kysteiinille ja metioniinille), Megaviruksella on kolme muuta (tryptofaanille, asparagiinille ja isoleusiinille). Cafeteria roenbergensis -viruksen koodaama ainutlaatuinen aminoasyylitRNA -syntetaasi vastaa isoleusiinia. Megavirus koodaa myös sulautunutta versiota epäsopivan DNA -korjausentsyymin MutS: stä, joka on ainutlaatuisesti samanlainen kuin oktokorallien mitokondrioissa. Tämä hämmentävä MutS -versio näyttää olevan Megaviridae -perheen tavaramerkki. Kuten Mimivirus ja CroV, myös Megavirus sisältää monia sokerin, lipidien ja aminohappojen käsittelyyn tarkoitettuja geenejä sekä joitakin aineenvaihduntageenejä, joita ei löydy mistään muusta viruksesta.

Replikointi

Megaviruksen replikaatiovaiheet seuraavat tarkasti Mimivirukselle jo kuvattua. Kun fagosytoosi on imeytynyt nopeasti ja hiukkasydin on toimitettu sytoplasmaan, alkaa pimennysvaihe. Tarkempi tarkastelu osoittaa sytoplasmisen "siementen" läsnäolon, joiden koko on verrattavissa Megavirus-hiukkasen kaikkein sisäiseen kalvoon suljettuun ytimeen. Nämä siemenet kehittyvät täyteen kukkineeseen virionitehtaaseen seuraavan 14 tunnin aikana. Koko infektion kulku (aivosolujen täydelliseen hajoamiseen asti) kestää keskimäärin 17 tuntia, kun taas Mimiviruksella 12 tuntia. Vapautuneita Megavirus -hiukkasia (eli "purskeen koko") on keskimäärin noin 500, puolet Mimiviruksen vapauttamasta tuhannesta.

Kuten odotettiin virukselta, joka koodaa omaa täydellistä DNA: n replikaatio-, korjaus- ja transkriptiokoneistoa, isäntäydin ei näytä osallistuvan mihinkään Megavirus -replikaatiovaiheeseen, kuten Mimiviruksen kohdalla on jo nähty.

Katso myös

Viitteet

Lue lisää

Ulkoiset linkit