Mycobacterium africanum -Mycobacterium africanum
Mycobacterium africanum | |
---|---|
Tieteellinen luokittelu | |
Verkkotunnus: | |
Pylum: |
" Actinobakteerit "
|
Luokka: | |
Tilaus: | |
Perhe: | |
Suku: | |
Laji: |
M. africanum
|
Binominen nimi | |
Mycobacterium africanum Castets et ai. 1969, ATCC 25420
|
Mycobacterium africanum on laji Mycobacterium joka on yleisimmin todettu Länsi-Afrikkalainen maissa, joissa on arvioitu aiheuttavan jopa 40% keuhkotuberkuloosi. Infektion oireet muistuttavat M. tuberculosis -oireita .
Se on Mycobacterium tuberculosis -kompleksin jäsen .
Taksonomia
Mycobacterium tuberculosis -kompleksissa (MTBC) on seitsemän päälinjaa , ja linjat 5 ja 6 luokitellaan Mycobacterium africanumiksi . MTBC -linja 5 on M. africanum tyyppi 1, Länsi -Afrikkalainen 1 (MAF1), ja se on luokiteltu alueellisen erilaistumisen (RD) 711. ominaisen poiston perusteella. MAF1: tä esiintyy yleisesti Guineanlahden ympäristössä. MTBC -linja 6 tunnetaan myös nimellä M. africanum type 1, West African 2 (MAF2), ja se luokitellaan RD702: n deleetion perusteella. MAF2 on yleinen Länsi -Afrikassa. M. africanum tyyppi 2, Itä -Afrikkalainen, tunnistettiin aiemmin Mycobacterium africanum -kannana ; se luokiteltiin äskettäin Mycobacterium tuberculosis -genotyypiksi "Uganda" MTBC -linjan 4 alalinjaan.
Historia
M. africanum kuvattiin ensin alalaji sisällä MTBC, jossa fenotyyppisten ominaisuuksien välissä M. tuberculosis ja M. bovis , jotka perustuvat biokemialliset testausta Castets vuonna 1968. Varhainen geneettinen analyysi osoitti, että se oli erillään M. tuberculosis vuoksi genominen RD9 -deleetio ja erillinen GyrB -nukleotidisekvenssi, ja erottuva M. boviksesta koskemattoman RD12: n ja RD4: n vuoksi.
Mikrobiologia
M. africanumia kasvatetaan pyruvaattia sisältävässä väliaineessa alhaisessa happiolosuhteissa ja muodostaa tyypillisiä "dysgonisia" pesäkkeitä. Toisin kuin M. tuberculosis , M. africanum esittää katalaasin aktiivisuutta, on nitraatti negatiivinen, ja se on altis tiopeeni-2-karboksyylihappohydratsidi (TCH) ja pyratsiiniamidi (PZA). M. africanum kasvaa myös hitaammin kuin M. tuberculosis , tyypillisesti kestää 10 viikkoa pesäkkeiden kehittämiseen eikä 3-4 tuberkuloosiin .
Epidemiologia
M. africanum esiintyy yleisimmin Länsi -Afrikan maissa. Se on vain ihmisten infektio ja leviää ilmateitse yksilöiltä, joilla on avoimia sairaustapauksia.
Ei ole täysin ymmärretty, miksi M. africanumin leviäminen rajoittuu Länsi -Afrikkaan, ja vain satunnaisia tapauksia esiintyy muilla alueilla. Fylogeneettiset todisteet osoittavat, että M. africanum haarautui varhaisessa vaiheessa nykyaikaisista Mtb -linjoista Amerikassa, Euroopassa ja Aasiassa. Jotkut tutkimukset viittaavat siihen, että M. africanum on sopeutunut Länsi -Afrikan populaatioihin. M. africanum saattaa kilpailla muiden Mtb -linjojen kanssa muilla alueilla; geneettisissä tutkimuksissa ei kuitenkaan ole havaittu eroa virulenssigeenien lukumäärässä tai geneettisessä monimuotoisuudessa M. tuberculosis- ja M. africanum -lajien välillä . Mycobacterium africanumille ei ole tunnistettu eläinsäiliötä, vaikka siitä on löydetty erilaisia villieläimiä.
Sillä on samanlainen tarttuvuusaste kuin tavallisella M. tuberculosis -organismilla, mutta on epätodennäköisempää edetä kliiniseen sairauteen immunokompetentilla yksilöllä. Kuitenkin M. africanum etenee todennäköisemmin infektiosta sairauden aiheuttamiseen HIV -positiivisella potilaalla. Maissa, joissa M. africanum on endeeminen, se edustaa tärkeää opportunistista infektiota HIV -taudin myöhemmissä vaiheissa.
Patogeneesi
Ei ole täysin ymmärretty, miten M. africanumin ja M. tuberculosis -lajin väliset geneettiset erot johtavat entisen taudinaiheuttajien heikompaan patogeenisuuteen. On kuitenkin tiedossa, että ero -alue 9 (RD9) puuttuu M. africanumissa, mutta on läsnä M. tuberculosis -taudissa .
M. africanumilla on myös huomattavia eroja lipidien kataboliassa ja aineenvaihdunnassa. Lisäksi virulenssireitit, kuten dosR/Rv0081 regulon tai ESAT-6-säätely, häiriintyvät M. africanumissa .
Hoito
Mycobacterium tuberculosis -lajin ja africanumin samanlaisten oireiden ja erilaisten kasvuolosuhteiden vuoksi viljelymenetelmät eivät ole luotettavia diagnoosin tekemiseen. Molekyylibiologiaan perustuva genotyypitys on parantanut tunnistamista. Erityisesti "spoligotyypitys" tai "spacer-oligonukleotidityppaus" on nopea polymeraasiketjureaktiopohjainen menetelmä MTBC-kantojen genotyypin määrittämiseksi. Viime aikoina on kehitetty lateraalivirtauksen nopeita testejä MTBC: n kaikissa jäsenissä esiintyvän mpt64 -antigeenin perusteella.
M. africanum etenee nopeammin latenssista aktiiviseen tautiin kuin M. tuberculosis . M. africanum tuberculosis -hoitoa hoidetaan samalla tavalla kuin M. tuberculosis -bakteerin aiheuttamaa tuberkuloosia . Yleinen paranemisprosentti on samanlainen, mutta koska useammat M. africanum -potilaat ovat todennäköisesti HIV-positiivisia, heillä voi olla suurempi kuolleisuus muihin HIV-sairauksiin.
Tyyppi kanta
ATCC 25420 = CIP 105147
Viitteet
Bibliografia
- Skerman, VBD; McGowan, V .; Sneath, PHA (tammikuu 1980). "Hyväksytyt bakteerien nimiluettelot" . Int. J. Syst. Bakterioli . 30 (1): 225–420. doi : 10.1099/00207713-30-1-225 .