Mycobacterium tuberculosis -kompleksi - Mycobacterium tuberculosis complex

Mycobacterium tuberculosis kompleksi ( MTC tai MTBC ) on geneettisesti liittyy joukko Mycobacterium lajeja, jotka voivat aiheuttaa tuberkuloosia ihmisissä tai muissa eläimissä.

Se sisältää:

Lisäksi on olemassa kaksi haaraa, joilla on filogeenisiä yhtäläisyyksiä, mutta joita ei ole kuvattu kokonaan: dassie- ja oryx -bakteerit. Oryx -bakteerit on äskettäin luokiteltu uudelleen erilliseksi alalajiksi, orygisiksi.

MTC: n jäsenet voidaan erottaa kaikista muista bakteereista 63 konservoidun allekirjoitusindelin (CSI) läsnä ollessa erilaisissa proteiineissa, jotka ovat yksinomaan näiden patogeenien yhteisiä. Koska nämä CSI: t ovat yksinoikeudella MTC -kompleksille ja läsnä proteiinien erittäin säilyneillä alueilla, ne tarjoavat uusia keinoja toiminnallisille ja diagnostisille tutkimuksille (mukaan lukien mahdolliset tavoitteet uusien lääkkeiden kehittämiselle).

Fylogenetiikka

Kun MTBC jakautui eri linjoihin, niin myös avain- ja metabolisten patogeenisten geenien ilmentyminen, johtuen mutaatioista, jotka esittivät uusia TANNNT Pribnow -laatikoita ja mutaatioita, jotka heikentävät Repcripcionales -repressorien toimintaa. Tämä antaa selvää näyttöä siitä, että MTBC -linjat heijastavat todennäköisesti sopeutumista eri ihmispopulaatioihin. Itse asiassa geeniekspression muuttaminen voisi olla nopea mekanismi fysiologiseen sopeutumiseen uuteen ympäristöön ilman tarvetta muuttaa olennaisesti genomia.

Tämä näkyy siinä, että eri MTBC -kludeilla on oma transkriptinen allekirjoituksensa. Jopa yhden pisteen mutaatiot voivat täysin muuttaa kannan transkriptioprofiilia. Esimerkki on N1177 -kanta, joka kantaa yhden mutaation rpoB -geenissä, joka antaa resistenssin rifampisiinille, joka muutti useiden geenien transkriptiotasoja.

Metylaation rooli on vaikeampi, mutaation inaktivointimalli näyttää vahvistavan, että metylaaseja ei säilytetä koko mtBC: n aikana. Transkriptionaalinen sopeutuminen voi mahdollistaa M. tuberculosis -isolaattien optimoida tarttuvuutensa ja tartuntansa hienovaraisesti erilaisissa ympäristöissä, joita eri ihmisen isäntäpopulaatiot tarjoavat.

Katso myös

Viitteet