Hänen vanhemman veljensä Ptolemaios XIII: n kuoleman jälkeen Egyptistä 13. tammikuuta 47 eaa., Ja hänen tahtonsa mukaan hänen vanhempi sisarensa ja jäljellä oleva farao , Egyptin Kleopatra VII, julistivat hänet faraoksi ja apuvalloittajaksi . Hän oli noin 12 -vuotias, kun hän nousi valtaistuimelle. Hän ja hänen vanhempi sisarensa Kleopatra olivat naimisissa, mutta Kleopatra jatkoi roomalaisen diktaattorin Julius Caesarin rakastajana . Ptolemaioksen katsotaan hallinneen vain nimeltä, myönnytyksenä egyptiläiselle perinteelle, ja Cleopatralla oli todellinen valta.
15. maaliskuuta 44 eaa Caesar murhattiin vuonna Roomassa ryhmä salaliittolaisten jonka merkittävimmät jäsenet olivat Marcus Junius Brutuksen ja Gaius Cassius Longinus . Ptolemaios seurasi häntä pian kuolemaansa. Kirjoitus, joka mainitsi hänet elävänä, oli päivätty 26. heinäkuuta 44 eaa. On oletettu, mutta on edelleen epävarmaa, että Kleopatra myrkytti apulaishallitsijansa akoniitilla korvatakseen hänet veljenpoikansa Ptolemaios XV Caesarilla , joka oli hänen poikansa Caesarilta, joka julistettiin osahallitsijaksi 2. syyskuuta 44 eaa. Ja jota hänen äitinsä aikoi tukea isänsä seuraajana.