Subgenominen mRNA - Subgenomic mRNA

Subgenomiset mRNA : t ovat olennaisesti pienempiä osia alkuperäisestä transkriptoidusta templaattisäikeestä .

3 '- 5' DNA tai RNA

Aikana transkription , alkuperäinen Templaattijuoste yleensä luetaan 3' sen 5' päähän alusta loppuun. Subgenomiset mRNA: t luodaan, kun transkriptio alkaa templaattisäikeen 3'-päästä (tai vasta syntetisoitavan templaatin 5'-päästä) ja alkaa kopioida kohti templaattisäikeen 5'-päätä ennen "hyppäämistä" loppuun ja kopioimalla templaatin 5'-pään viimeiset nukleotidit (viimeistelemällä vasta luodun juosteen 3'-häntä).

Tämän seurauksena käännetyllä säikeellä on samanlainen 5'-pää vaihtelevassa määrin alkuperäisen mallin kanssa (riippuen siitä, minkä mallin osan transkriptio hyppäsi yli) ja samanlainen 3'-pää malliin.

5 '- 3' (positiivinen tunne) viruksen RNA

Positiivisen aistin (5 '- 3') virus-RNA, joka voidaan transloida suoraan haluttuihin virusproteiineihin, käy läpi samanlaisen prosessin kuin on kuvattu kohdissa 3 '- 5'. Viruksen RNA: n osat voidaan ohittaa translaation aikana.

Tulos

Tuloksena on, että samasta mRNA-juosteesta voidaan luoda monia erilaisia proteiineja , joilla on samanlaiset 5'-päät (vaihtelevassa määrin) ja samat 3'-päät. Tai voidaan luoda erilaisia ​​proteiineja positiivisella sense-viruksen RNA: lla.

Äskettäin luodun juosteen 5'-osio vastaa mallinauhan osaa, ja tähän malliosan jaksoon viitataan "sisäkkäisenä joukkona".

3'                                                          5'
 GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATACGTTATTTCTGCGCGGAAAAAAAAA - Original template Strand
 
5'                                                          3'
 GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATAC---------------AAAAAAAAA      |
 GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCAC--------------------------AAAAAAAAA      | = Subgenomic mRNA. 
 GCCGCCCCGTAT----------------------------------------AAAAAAAAA      |
 
 GCCGCCCCGTAT = Nested Set  - indicates jumps.

Esimerkkejä

Tämä monimutkainen transkriptiomenetelmä on yleensä rajoitettu viruksiin , erityisesti yksisäikeisiin, positiivisen mielen RNA- tai luokan IV viruksiin, jotka käyttävät Baltimore-luokitusjärjestelmää , esim . Nidovirales- luokan viruksiin .

Sitä käytetään ensisijaisesti tiivistämään enemmän geneettistä tietoa lyhyempään määrään geneettistä materiaalia.

Kirjallisuus