Proteiinityrosiinifosfataasi - Protein tyrosine phosphatase
| Proteiini-tyrosiinifosfataasi | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Proteiinityrosiinifosfataasi 1, trimeeri, ihminen
| |||||||||
| Tunnisteet | |||||||||
| EY -nro | 3.1.3.48 | ||||||||
| CAS -nro | 79747-53-8 | ||||||||
| Tietokannat | |||||||||
| IntEnz | IntEnz -näkymä | ||||||||
| BRENDA | BRENDA -merkintä | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme -näkymä | ||||||||
| KEGG | KEGG -merkintä | ||||||||
| MetaCyc | aineenvaihduntareitti | ||||||||
| PRIAM | profiili | ||||||||
| ATE -rakenteet | RCSB PDB PDBe ATE | ||||||||
| |||||||||
Proteiini tyrosiinifosfataaseilla ovat ryhmä entsyymejä, jotka poistavat fosfaatti ryhmät fosforyloidun tyrosiinin tähteitä proteiineissa. Proteiinityrosiinin (pTyr) fosforylaatio on yleinen translaation jälkeinen muutos, joka voi luoda uusia tunnistusmotiiveja proteiinien vuorovaikutuksille ja solujen paikallistumiselle, vaikuttaa proteiinin stabiilisuuteen ja säätää entsyymiaktiivisuutta. Tämän seurauksena proteiinityrosiinin fosforylaation asianmukaisen tason ylläpitäminen on välttämätöntä monille solutoiminnoille. Tyrosiinispesifiset proteiinifosfataasit (PTPaasi; EC 3.1.3.48 ) katalysoivat tyrosiinitähteeseen kiinnittyneen fosfaattiryhmän poistamista käyttämällä kysteinyylifosfaattientsyymin välituotetta. Nämä entsyymit ovat keskeisiä säätelykomponentteja signaalinsiirtoreiteissä (kuten MAP -kinaasireitti ) ja solusyklin ohjauksessa, ja ne ovat tärkeitä solujen kasvun , lisääntymisen , erilaistumisen , transformaation ja synaptisen plastisuuden kontrolloinnissa .
Toiminnot
Yhdessä tyrosiinikinaasien , PTP: t säätelevät fosforylaation tila monia tärkeitä signaloinnin molekyylejä, kuten MAP-kinaasin perhe. PTP: itä pidetään yhä enemmän signaalinsiirtokaskadien olennaisina osina , vaikka tutkimusta ja ymmärrystä on vähemmän kuin tyrosiinikinaaseja .
PTP: t ovat osallistuneet monien soluprosessien säätelyyn, mukaan lukien, mutta ei rajoittuen:
Luokitus
Mekanismin mukaan
PTP -aktiivisuutta löytyy neljästä proteiiniperheestä.
Linkit kaikkiin 107 proteiinityrosiinifosfataasiperheen jäsentä löytyvät tämän artikkelin alareunassa olevasta mallista .
Luokka I
Luokan I PTP: t ovat suurin PTP -ryhmä, johon kuuluu 99 jäsentä, jotka voidaan jakaa edelleen
- 38 klassista PTP: tä
- 21 reseptorityrosiinifosfataasia
- 17 ei-reseptorityyppistä PTP: tä
- 61 VH-1: n kaltaista tai kaksoisspesifistä fosfataasia (DSP)
- 11 MAPK -fosfataasia (MPK)
- 3 Slingshotsia
- 3 PRL: ää
- 4 CDC14
- 19 epätyypillistä DSP: tä
- 5 fosfataasi- ja tensiinihomologia (PTEN)
- 16 myotubulariinia
Dual-spesifisyys fosfataasit (DTyr ja DSer / dThr) kahden spesifisyyden proteiini-tyrosiini fosfataasit . Ser/Thr ja Tyr kaksispesifiset fosfataasit ovat ryhmä entsyymejä, joilla on sekä Ser/Thr ( EC 3.1.3.16 ) että tyrosiinispesifinen proteiinifosfataasiaktiivisuus ( EC 3.1.3.48 ), jotka pystyvät poistamaan seriini / treoniini tai tyrosiiniin sitoutuneet fosfaattiryhmä monista fosfoproteiineista , mukaan lukien joukko entsyymejä, jotka on fosforyloitu kinaasin vaikutuksesta . Kaksispesifiset proteiinifosfataasit (DSP) säätelevät mitogeenistä signaalinsiirtoa ja säätelevät solusykliä.
LEOPARD -oireyhtymä , Noonan -oireyhtymä ja metakondromatoosi liittyvät PTPN11: een .
Aktivoidun PTPN5: n kohonneet tasot vaikuttavat negatiivisesti synaptiseen vakauteen ja vaikuttavat Alzheimerin tautiin , Fragile X -oireyhtymään , skitsofreniaan ja Parkinsonin tautiin . Alentuneita PTPN5 on liitetty Huntingtonin tauti , aivoiskemia , alkoholin käyttö häiriö , ja stressi häiriöt. Yhdessä nämä havainnot osoittavat, että vain optimaalisilla PTPN5 -tasoilla synaptinen toiminta ei heikkene .
Luokka II
LMW (pienimolekyylipainoiset) fosfataasit tai happamat fosfataasit vaikuttavat tyrosiinifosforyloituihin proteiineihin, matalan MW-aryylifosfaatteihin ja luonnollisiin ja synteettisiin asyylifosfaatteihin .
Luokan II PTP: t sisältävät vain yhden jäsenen, pienimolekyylipainoisen fosfotyrosiinifosfataasin ( LMPTP ).
Luokka III
Cdc25 -fosfataasit (dTyr ja/tai dThr)
Luokan III PTP: t sisältävät kolme jäsentä, CDC25 A , B ja C
Luokka IV
Nämä ovat HAD -taitoksen ja superperheen jäseniä, ja ne sisältävät pTyr- ja pSer/Thr -spesifisiä fosfataaseja sekä pienimolekyylisiä fosfataaseja ja muita entsyymejä. Alaperheen EYA (silmät puuttuvat) uskotaan olevan pTyr-spesifinen, ja siinä on neljä ihmistä, EYA1 , EYA2 , EYA3 ja EYA4 . Tällä luokalla on erillinen katalyyttinen mekanismi muista kolmesta luokasta.
Sijainnin mukaan
Solun lokalisoinnin perusteella PTPaasit luokitellaan myös seuraaviksi:
- Reseptorimaiset, jotka ovat kalvon läpäiseviä reseptoreita, jotka sisältävät PTPaasi- domeeneja . Rakenteeltaan kaikki tunnetut reseptorin PTPaasit koostuvat vaihtelevan pituisesta solunulkoisesta domeenista , jota seuraa transmembraanialue ja C-terminaalinen katalyyttinen sytoplasminen domeeni. Jotkut reseptorin PTPaaseista sisältävät fibronektiinityypin III (FN -III) toistoja, immunoglobuliinin kaltaisia domeeneja, MAM -domeeneja tai hiilihappoanhydraasin kaltaisia domeeneja solunulkoisella alueellaan. Yleensä sytoplasminen alue sisältää kaksi kopiota PTPaasi -domeenista. Ensimmäisellä näyttää olevan entsymaattinen aktiivisuus, kun taas toisella ei ole aktiivisuutta.
- Ei-reseptoriset (solunsisäiset) PTPaasit
Yhteiset elementit
Kaikki PTPases, muut kuin ne, joilla on Eya perhe, kuljettaa erittäin konservoituneen aktiivisen motiivin C (X) 5R (PTP allekirjoitus motiivi), käytetään yhteistä katalyyttinen mekanismi, ja niillä on samanlainen ydin-rakenne, joka on valmistettu keskeinen rinnakkain beeta-levyn , jossa on reunustavat alfa-heliksiivit, jotka sisältävät beta-silmukka-alfa-silmukan, joka sisältää PTP-allekirjoitusmotiivin. PTPaasien toiminnallinen monimuotoisuus on varustettu sääntelyalueilla ja alayksiköillä.
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ilmaisukuvio
Yksittäisiä PTP: itä voivat ilmentää kaikki solutyypit tai niiden ilmentyminen voi olla tiukasti kudoskohtaista . Useimmat solut ilmentävät 30–60% kaikista PTP -yhdisteistä, mutta hematopoieettiset ja hermosolut ilmentävät enemmän PTP -soluja verrattuna muihin solutyyppeihin. T -solut ja hematopoieettista alkuperää olevat B -solut ilmentävät noin 60-70 erilaista PTP: tä. Ekspression useita PTPS rajoittuu hematopoieettisia soluja, esimerkiksi, LYP , SHP1 , CD45 , ja HePTP . PTPN5: n ilmentyminen rajoittuu aivoihin. PTPN5: n erilaista ilmentymistä esiintyy monilla aivojen alueilla ilman ilmentymistä pikkuaivoissa.
Viitteet
Lähteet
Ulkoiset linkit
- PTP Yhteenveto ja asiaan liittyvistä julkaisuista on Monash University
- Proteiini-tyrosiinifosfataasi Yhdysvaltain kansallisen kirjaston lääketieteellisissä aihealueissa (MeSH)
- EY 3.1.3.48
