LDB3 - LDB3
LIM-domeenin sitoutuminen 3 ( LDB3 ), joka tunnetaan myös nimellä Z-kaista vaihtoehtoisesti silmukoituna PDZ -motiivi ( ZASP ), on proteiini, jota ihmisissä koodaa LDB3- geeni . ZASP kuuluu Enigma-proteiinien alaryhmään ja stabiloi sarkoomin (lihasten perusyksiköt) supistumisen aikana vuorovaikutuksessa sydämen ja luuston lihasten aktiinin kanssa . ZASP-geenin mutaatioihin on liittynyt useita lihasten sairauksia .
Rakenne
ZASP on PDZ- domeenia sisältävä proteiini. PDZ-motiivit ovat modulaarisia proteiini-proteiini-vuorovaikutusdomeeneja, jotka koostuvat 80-120 aminohappotähteestä. PDZ-domeenin sisältävät proteiinit ovat vuorovaikutuksessa toistensa kanssa sytoskeletalisessa kokoonpanossa tai muiden proteiinien kanssa, jotka osallistuvat membraaniproteiinien kohdentamiseen ja klustereihin. ZASP on vuorovaikutuksessa alfa- aktiniini -2: n kanssa sen N-terminaalisen PDZ-domeenin ja proteiinikinaasi C : n kanssa sen C-terminaalisten LIM-domeenien kautta . LIM-domeeni on 50-60 aminohapolla määritelty kysteiinipitoinen motiivi, joka sisältää kaksi sinkkiä sitovaa moduulia. Tämä proteiini on myös vuorovaikutuksessa kaikkien kolmen myozenin- perheen jäsenen kanssa .
Ihmisen ZASP voi esiintyä sydän- ja luusoluissa kuuteen erillisenä isoformina, jotka perustuvat 16 eksonin vaihtoehtoiseen silmukointiin. ZASP: n lyhyitä muotoja on 2 (Uniprot ID: O75112-6, 31,0 kDa, 283 aminohappoa; ja Uniprot ID: O75112-5, 35,6 kDa, 330 aminohappoa); ja 4 ZASP-pitkää muotoa (Uniprot ID: O75112-4, 42,8 kDa, 398 aminohappoa; Uniprot ID: O75112-3, 50,6 kDa, 470 aminohappoa; Uniprot ID: O75112-2, 66,6 kDa, 617 aminohappoa ja Uniprot ID: O75112, 77,1 kDa, 727 aminohappoa). Kaikilla ZASP-isoformeilla on N-terminaalinen PDZ-domeeni ; sisäiset, konservoituneet sekvenssit, jotka tunnetaan nimellä ZASP: n kaltaiset motiivit (ZM); ja neljällä pitkällä isomuodolla on kolme C-terminaalista LIM-domeenia .
Toiminto
ZASP toimii sarkomeerien rakenteellisen eheyden ylläpitämiseksi supistumisen aikana, ja sen on osoitettu osallistuvan proteiinikinaasi A- signalointiin. ZASP: n on myös osoitettu aktivoivan a5β1- integriinejä yhdessä TLN1- proteiinin kanssa .
Lääketieteellinen merkitys
Mutaatiot ZASP on yhdistetty myofibrii- myopatiaa , laajentuneet kardiomyopatia , rytmihäiriöitä oikean kammion kardiomyopatia , noncompaction kardiomyopatia , ja lihasdystrofia .
Vuorovaikutukset
PDZ domeeni on ZASP sitoo C-terminaalissa on alfa aktiini-2 ja ZM: iin sitoutuvat tangon domeenin alfa aktiini-2 . LIM domeenit on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa proteiinikinaasi C . Eksonin 4 koodaama ZASP: n sydämen spesifinen alue sisältää ZP-motiivin ja sitoo proteiinikinaasi A: n säätelyalayksikön .
Katso myös
Viitteet
Lisälukemista
- Marziliano N, Mannarino S, Nespoli L, Diegoli M, Pasotti M, Malattia C et ai. (Toukokuu 2007). "Barth-oireyhtymä, joka liittyy TAZ- ja LDB3-geenien yhdistettyyn hemizygoosuuteen ja heterotsygoottisuuteen". American Journal of Medical Genetics A osa . 143A (9): 907–15. doi : 10.1002 / ajmg.a.31653 . HDL : 2434/45968 . PMID 17394203 . S2CID 20328643 .
- Klaavuniemi T, Ylänne J (toukokuu 2006). "Zasp / Cypherin sisäinen ZM-motiivi, joka sisältää fragmentit, ovat riittäviä paikallistumaan alfa-aktiniinin kanssa - potilaan mutaatioiden analyysi". Kokeellinen solututkimus . 312 (8): 1299–311. doi : 10.1016 / j.yexcr.2005.12.036 . PMID 16476425 .
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R et ai. (Tammikuu 2006). "Transkriptiomodulaation monipuolistaminen: ihmisen geenien oletettujen vaihtoehtoisten promoottorien laajamittainen tunnistaminen ja karakterisointi" . Genomitutkimus . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101 / gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
- Frey N, Olson EN (huhtikuuta 2002). "Calsarcin-3, uusi calsarcin-perheen luurankolihaspesifinen jäsen, on vuorovaikutuksessa useiden Z-kiekkoproteiinien kanssa" . Journal of Biological Chemistry . 277 (16): 13998–4004. doi : 10.1074 / jbc.M200712200 . PMID 11842093 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (marraskuu 2000). "DNA-kloonaus käyttämällä in vitro -kohtaista rekombinaatiota" . Genomitutkimus . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
- Passier R, Richardson JA, Olson EN (huhtikuuta 2000). "Oracle, uusi PDZ-LIM-domeeniproteiini ilmaistuna sydämen ja luuston lihaksissa" . Kehitysmekanismit . 92 (2): 277–84. doi : 10.1016 / S0925-4773 (99) 00330-5 . PMID 10727866 . S2CID 18254892 .
- Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (kesäkuu 1998). "Tunnistamattomien ihmisen geenien koodaavien sekvenssien ennustaminen. X. 100 uuden aivojen cDNA-kloonin täydelliset sekvenssit, jotka voivat koodata suuria proteiineja in vitro" . DNA-tutkimus . 5 (3): 169–76. doi : 10.1093 / dnares / 5.3.169 . PMID 9734811 .
- Lanfranchi G, Muraro T, Caldara F, Pacchioni B, Pallavicini A, Pandolfo D et ai. (Tammikuu 1996). "4370 ekspressoidun sekvenssileiman tunnistaminen ihmisen luurankolihaksen 3'-pään spesifisestä cDNA-kirjastosta DNA-sekvensoinnilla ja suodatinhybridisaatiolla" . Genomitutkimus . 6 (1): 35–42. doi : 10.1101 / gr.6.1.35 . PMID 8681137 .
Ulkoiset linkit
- GeneReviews / NIH / NCBI / UW-merkintä myofibrillaarisesta myopatiasta
- Yleiskuvan kaikista rakenteellista tietoa saatavilla ATE varten UniProt : O75112 (Human LIM domain-sitova proteiini 3) on PDBe-KB .
- Yleiskuvan kaikista rakenteellista tietoa saatavilla ATE varten UniProt : Q9JKS4 (Mouse LIM domain-sitova proteiini 3) on PDBe-KB .
Tämä artikkeli sisältää Yhdysvaltojen kansallisen lääketieteellisen kirjaston tekstiä , joka on julkista .