Kasvaimen nekroositekijän superperhe - Tumor necrosis factor superfamily
Kasvaimen nekroositekijän superperhe | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Mus musculusin tuottaman TNF-alfan trimeerinen rakenne perustuu PDB-rakenteeseen 2TNF (1,4 Å: n resoluutio). Eri värit edustavat erilaisia monomeereja. Baeyens, KJ et ai. (1999). Kuva renderöitiin FirstGlance Jmolilla.
| |||||||||
Tunnisteet | |||||||||
Symboli | TNF | ||||||||
Pfam | PF00229 | ||||||||
InterPro | IPR006052 | ||||||||
PROSITE | PDOC00224 | ||||||||
SCOP2 | 1tnf / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
OPM-superperhe | 292 | ||||||||
OPM-proteiini | 2hew | ||||||||
Kalvo | 80 | ||||||||
|
TNF | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
polun-sdr5 kristallirakenne
| |||||||||
Tunnisteet | |||||||||
Symboli | TNF | ||||||||
Pfam | PF00229 | ||||||||
Pfam- klaani | CL0100 | ||||||||
InterPro | IPR006052 | ||||||||
PROSITE | PDOC00561 | ||||||||
SCOP2 | 1tnr / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
|
Tuumorinekroositekijä ( TNF ) superperheen on proteiini superperheen on tyypin II transmembraaniproteiineja , joka sisältää TNF-homologiadomeeni ja muodostaa trimeerejä . Tämän superperheen jäsenet voidaan vapauttaa solukalvosta solunulkoisella proteolyyttisellä pilkkomisella ja toimia sytokiinina . Näitä proteiineja ilmentävät pääasiassa immuunisolut ja ne säätelevät solujen erilaisia toimintoja, mukaan lukien immuunivaste ja tulehdus, mutta myös lisääntymistä, erilaistumista, apoptoosia ja embryogeneesiä.
Superperhe sisältää 19 jäsentä, jotka sitoutuvat 29 jäseneen TNF-reseptorin superperheestä . Esiintyminen ortologeihin vuonna selkärangattomien vihjeet muinaista perua tämän Yläheimo evoluutiossa.
PROSITE kuvio Tämän superperheen sijaitsee beeta-levyn keskiosassa on proteiini, joka on konservoitunut kaikissa jäsenet.
Jäsenet
Perheenjäseniä on 19, luokiteltu numeerisesti TNFSF #: ksi, jossa # tarkoittaa jäsenmäärää, jota seuraa joskus kirjain.
TNFSF # | Nimi | Synonyymit | Geeni | Toiminto |
---|---|---|---|---|
1 | Lymfotoksiini alfa | TNFp, TNFSF1B | LTA | Tulehduksen ja antiviraalisen vasteen indusointi, sekundääristen lymfoidisten elinten kehittyminen , rooli tuumorigeneesissä |
2 | Kasvaimen nekroositekijä | TNFα, Dif, nekrosiini, TNFSF1A, ... | TNF | Immuunisolujen säätely, kuumeen , kakeksian , tulehduksen ja apoptoosin induktio , tuumorigeneesin ja viruksen replikaation esto ja vaste sepsikselle |
3 | Lymfotoksiini beeta | TNFy | LTB | Tulehduksen ja antiviraalisen vasteen indusointi, sekundääristen lymfoidisten elinten kehittyminen , rooli tuumorigeneesissä |
4 | OX40-ligandi | CD252, Gp34, CD134L | TNFSF4 | T-solujen immuunivasteen aktivointi T-solujen kostimulaatiolla |
5 | CD40-ligandi | CD154, TRAP, Gp39, T-BAM | CD40LG | Sääntely adaptiivisen immuunivasteen aktivoimalla antigeeniä esittelevä solu |
6 | Fas-ligandi | CD178, APTL, CD95L | FASLG | Säätely T-solujen homeostaasiin induktion apoptoosin |
7 | CD27-ligandi | CD70 | CD70 | Säätely B-solujen aktivaation ja T-solujen homeostaasin |
8 | CD30-ligandi | CD153 | TNFSF8 | Induktio apoptoosin ja T-solujen ja B-solujen , ehkäisy autoimmuniteetin |
9 | CD137-ligandi | 4-1 BBL | TNFSF9 | |
10 | TNF: ään liittyvä apoptoosia indusoiva ligandi | CD253, APO-2L | TNFSF10 | Estäminen tuumorigeneesin , induktion apoptoosin |
11 | Ydintekijän kappa-Β-ligandin reseptoriaktivaattori | CD254, OPGL, TRANCE, ODF | TNFSF11 | Kudosten kasvu (erityisesti luiden uudistuminen ja uudistuminen), dendriittisolujen kypsyminen |
12 | TNF: ään liittyvä heikko apoptoosin indusoija | APO-3L, DR3L | TNFSF12 | Sääntely angiogeneesin induktio apoptoosin |
13 | Lisääntymistä indusoiva ligandi | CD256, TALL-2, TRDL1 | TNFSF13 | Säätely B-solujen kehityksen ja plasman solujen eloonjäämistä |
13B | B-solua aktivoiva tekijä | CD257, BLyS, TALL-1, TNFSF20, ... | TNFSF13B | B-solujen lisääntymisen ja erilaistumisen stimulointi |
14 | VALO | CD258, HVEML | TNFSF14 | T-solujen lisääntymisen stimulointi , apoptoosin säätely |
15 | Verisuonten endoteelikasvun estäjä | TL1, TL-1A | TNFSF15 | Angiogeneesin esto |
18 | TNF-superperheen jäsen 18 | GITRL, AITRL, TL-6 | TNFSF18 | Säätely T-solujen eloonjäämisen |
19 | Ectodysplasiini A | ED1-A1, ED1-A2 | EDA | Kehittäminen ektodermaalinen kudosten |
Viitteet
Ulkoiset linkit
- Kasvain + nekroosi + tekijät Yhdysvaltain kansallisen lääketieteellisen kirjaston lääketieteellisten aiheiden otsikoissa (MeSH)
- pex1-tuumorinekroositekijän geeni