Mikrokromosomi - Microchromosome
Microchromosome on eräänlainen hyvin pieni kromosomi , joka on tyypillinen komponentti karyotyyppi ja lintujen , jotkut matelijat , kalat , ja sammakkoeläimet ; niitä ei yleensä ole nisäkkäissä . Ne ovat kooltaan alle 20 Mt; kromosomit, joiden koko on yli 40 Mt , tunnetaan makrokromosomeina , kun taas 20–40 Mt: n kromosomit luokitellaan välikromosomeiksi . Mikrokromoso- ovat tyypillisesti hyvin pieniä ja usein sytogeneettisesti mahdoton on karyotyyppi . Vaikka alun perin ajateltiin olevan merkityksettömiä kromosomifragmentteja, lajeissa, joissa niitä on tutkittu, niiden on havaittu olevan runsaasti geenejä . In kanat , mikrokromoso- on arvioitu sisältävän välillä 50 ja 75% kaikista geeneistä. Mikrokromosomien läsnäolo tekee kromosomien järjestämisen ja tunnistamisen koherentiksi karyotyypiksi erityisen vaikeaksi. Aikana metafaasivaiheeseen , ne näkyvät pelkästään 0,5-+1,5 im pitkä pilkkuja. Niiden pieni koko ja heikko kondensaatio heterokromatiiniksi tarkoittavat, että niiltä puuttuu yleensä diagnostinen raidoitusmalli ja erilliset sentromeeripaikat, joita käytetään kromosomien tunnistamiseen.
Linnuissa
Linnuilla (paitsi Falconidae ) karyotyyppejä on yleensä noin 80 kromosomia ( 2n = 80 ), vain harvat ovat erotettavissa olevia makrokromosomeja ja keskimäärin 60 mikrokromosomia. Niitä on enemmän lintuissa kuin missään muussa eläinryhmässä. Kanat ( Gallus gallus ) ovat tärkeä malliorganismi mikrokromosomien tutkimiseen. Lintujen mikrokromosomien tutkiminen on johtanut hypoteeseihin, joiden mukaan ne ovat saattaneet olla peräisin esivanhempien makrokromosomien konservoituneista fragmenteista, ja päinvastoin, että makrokromosomit voisivat syntyä mikrokromosomien aggregaateina. Vertaileva genominen analyysi osoittaa, että mikrokromoso- sisältävät geneettistä informaatiota, joka on konservoitunut useiden luokkien kromosomeja. Tämä osoittaa, että vähintään kymmenen kanan mikrokromosomia syntyi suurempien kromosomien fissiosta ja että tyypillinen lintukaryotyyppi syntyi 100–250 mya .
Kanat
Kanoilla on diploidinen määrä 78 (2 n = 78) kromosomia, ja kuten linnuilla tavallista, suurin osa on mikrokromosomeja. Kanan kromosomien luokittelu vaihtelee tekijän mukaan. Jotkut luokittelevat ne 6 makrokromosomipariksi, yhdeksi sukupuolikromosomipariksi, ja loput 32 paria ovat väli- tai mikrokromosomeja. Muita järjestelyjä, kuten kansainvälisen kanan genomin sekvensointikonsortion käyttämiä, ovat viisi makrokromosomiparia, viisi välikromosomiparia ja kaksikymmentäkahdet mikrokromosomiparia. Mikrokromosomit edustavat noin kolmannes koko genomin koosta, ja niiden on havaittu olevan paljon suurempi geenitiheys kuin makrokromosomeilla. Tämän vuoksi arvioidaan, että suurin osa geeneistä sijaitsee mikrokromosomeissa, vaikka mikrokromosomien fyysisen tunnistamisen vaikeuden ja mikrosatelliittimerkkien puuttumisen vuoksi geenien sijoittaminen spesifisiin mikrokromosomeihin on ollut vaikeaa.
Replikaation ajoituksen ja rekombinaatioprosenttien on havaittu eroavan kanojen mikrokromosomien ja makrokromosomien välillä. Mikrokromoso- toistaa aiemmin S-vaiheessa on välifaasin kuin macrochromosomes. Rekombinaatioprosenttien on myös havaittu olevan korkeammat mikrokromosomeissa. Mahdollisesti koska suuri rekombinaation hinnat, kana kromosomi 16 (a microchromosome) on todettu sisältävän kaikkein geneettisen monimuotoisuuden tahansa kromosomin tietyissä kana rotuja . Tämä johtuu todennäköisesti tärkeimmän histokompatibiliteettikompleksin (MHC) läsnäolosta tässä kromosomissa.
Kanan genomin monille pienille sidosryhmille, joita ei ole sijoitettu kromosomeihin, on oletettu, että ne sijaitsevat mikrokromosomeissa. Näiden ryhmät vastaavat melkein täsmälleen suuria osia tietyistä ihmisen kromosomeista. Esimerkiksi sidosryhmät E29C09W09, E21E31C25W12, E48C28W13W27, E41W17, E54 ja E49C20W21 vastaavat kromosomia 7 .
Turkki
Kalkkuna on diploidi lukumäärä 80 (2 n = 80) kromosomeja. Karyotyyppi sisältää ylimääräisen kromosomiparin kanaan nähden, koska läsnä on ainakin kaksi fissio / fuusioeroa (GGA2 = MGA3 ja MGA6 ja GGA4 = MGA4 ja MGA9). Ottaen huomioon nämä makrokromosomeihin liittyvät erot, mikrokromosomeja sisältävien lajien välillä on oltava myös uusi fissio / fuusio, jos diploidiluvut ovat päteviä. Muut järjestelyt on tunnistettu vertailevien geenikarttojen, fyysisten karttojen ja koko genomin sekvensoinnin avulla.
Kilpikonnissa
Mikrokromoso- keskeisessä asemassa sukupuoliasioissa in pehmytkuorisia kilpikonnia .
Ihmisillä ja muilla eläimillä
Mikrokromosomeja ei ole nisäkkäiden , krokotiilien ja sammakoiden karyotyypeissä .
Harvinaisissa tapauksissa mikrokromosomeja on havaittu yksittäisten ihmisten karotyypeissä. Yhteyttä mikrokromosomien läsnäolon ja tiettyjen geneettisten häiriöiden, kuten Downin oireyhtymän ja hauras X-oireyhtymän, välillä on ehdotettu . Ihmisten pienin kromosomi on normaalisti kromosomi 21 , joka on 47 Mb.