SARS-CoV-2 Beta-versio- SARS-CoV-2 Beta variant

Maat, joissa on vahvistettu beeta -variantin tapauksia 25.6.2021 alkaen
Selite:

  1000+ vahvistettua sekvenssiä

  250–999 vahvistettua sekvenssiä

  100–249 vahvistettua sekvenssiä

  10–99 vahvistettua sekvenssiä

  2–9 vahvistettua sekvenssiä

  1 vahvistettu sekvenssi

  Tietoja ei ole tai ei ole saatavilla

Beeta-variantti , joka tunnetaan myös nimellä linjaa B.1.351 , on muunnos on SARS-CoV-2 , virus, joka aiheuttaa COVID-19 . Yksi useista SARS-CoV-2-muunnelmista, joiden uskotaan olevan erityisen tärkeitä , se havaittiin ensimmäisen kerran Etelä-Afrikan Itä-Kapin maakunnan Nelson Mandela Bayn metropolialueella lokakuussa 2020, jonka maan terveysosasto raportoi 18. joulukuuta 2020. Fylogeografisen analyysin mukaan tämä variantti ilmestyi Nelson Mandela Bayn alueelle heinä- tai elokuussa 2020.

Maailman terveysjärjestö merkitty varianttia Beta variantti, ei korvata tieteellinen nimi, mutta nimenä yleisölle yleisesti viitata. WHO pitää sitä huolestuttavana vaihtoehtona .

Mutaatiot

• 

  SARS-CoV-2-beeta-variantin aminohappomutaatiot piirrettiin SARS-CoV-2: n genomikartalle keskittyen Spikeen.

Sukulinjan B.1.351 genomin piikki -alueella on kolme erityisen kiinnostavaa mutaatiota:

• K417N
• E484K
• N501Y

ja viisi muuta piikkimutaatiota, jotka ovat tähän mennessä aiheuttaneet vähemmän huolta:

• L18F
• D80A
• D215G
• R246I
• A701V

Poissa piikkialueelta se sisältää myös: K1655N, SGF 3675-3677 -poisto, P71L ja T205I.

Tutkijat totesivat, että muunnelma pystyy kiinnittymään helpommin ihmissoluihin, koska viruksen piikin glykoproteiinissa on kolme mutaatiota reseptoria sitovassa domeenissa (RBD) : N501Y (muutos asparagiinista (N) tyrosiiniksi (Y) aminohappoasema 501), K417N ja E484K. Kaksi näistä mutaatioista, E484K ja N501Y, ovat reseptoria sitovan alueen (RBD) reseptoria sitovassa motiivissa (RBM).

N501Y -mutaatio on havaittu myös Yhdistyneessä kuningaskunnassa. Kaksi beta -variantista löydettyä mutaatiota, E484K ja K417N, eivät löydy alfa -variantista . Beetalla ei myöskään ole 69-70del-mutaatiota, joka löytyy toisesta variantista.

Rokotteen teho

4. tammikuuta 2021 Ison-Britannian sanomalehti The Telegraph kertoi, että Oxfordin immunologi Sir John Bell uskoi, että uuden eteläafrikkalaisen variantin mahdollinen vastustuskyky COVID-19-rokotteita kohtaan oli "suuri kysymysmerkki" , mikä herätti pelkoa siitä, että rokotteet eivät ehkä toimi niin tehokkaasti. muunnoskanta. Samana päivänä Witwatersrandin yliopiston rokotustieteen professori Shabir Madhi kommentoi CBS Newsille, että "ei ole itsestään selvää", että uusi beta -variantti (501.V2 -muunnos) pystyy kiertämään rokotteet, mutta sen pitäisi katsotaan, että niillä "ei ehkä ole täyttä tehoa". Simon Clarke, Readingin yliopiston solumikrobiologian apulaisprofessori, nosti huolestuttavaksi tekijäksi lisämutaatit piikaproteiinille beetassa , koska ne "voivat tehdä viruksesta vähemmän alttiita rokotteiden aiheuttamalle immuunivasteelle" . Lawrence Young, virologi Warwickin yliopistosta , totesi myös, että variantin useat piikkimutaatiot "voivat johtaa pakoon immuunisuojaa".

E484K-aminohappomuutoksen, reseptoria sitovan domeenin (RBD) mutaation, raportoitiin liittyvän "pakoon neutraloivista vasta-aineista", mikä voisi vaikuttaa haitallisesti piikkiproteiiniriippuvaisten COVID-rokotteiden tehoon. E484K-piikkimutaatio yhdistettiin tapaukseen, jossa Brasiliassa SARS-CoV-2 : n beeta-variantilla tapahtui uudelleeninfektio , jonka tutkijat uskovat olevan ensimmäinen tällainen uudelleeninfektio, johon liittyy tämä mutaatio. Mahdollisuutta muuttaa antigeenisuutta kutsuttiin "pakomutaatioksi" monoklonaalisesta vasta-aineesta, joka kykenee neutraloimaan SARS-CoV-2: n piikkiproteiinivariantit. Tämä viittaa siihen, että olemassa olevat rokotteet voidaan ja pitäisi päivittää uusien kantojen torjumiseksi ilman vaiheittaisia ​​kokeita.

Janssen

Tammikuussa Johnson & Johnson , joka järjesti Janssen (Ad26.COV2.S) -rokotteensa kokeita Etelä-Afrikassa , ilmoitti, että suojelun taso kohtalaista tai vaikeaa COVID-19-infektiota vastaan ​​oli 72% Yhdysvalloissa ja 64% Yhdysvalloissa. Etelä -Afrikka .

Pfizer - BioNTech

Pfizer ilmoitti 17. helmikuuta 2021, että Beta -variantin neutralointiaktiivisuus väheni kahdella kolmanneksella, mutta pidättäytyi väittämästä rokotteen tehokkuudesta sairauden ehkäisemisessä tämän muunnoksen seurauksena.

Etelä-Afrikan terveystuotteiden sääntelyviranomainen (SAHPRA) hyväksyi 16. maaliskuuta 2021 Pfizer-BioNTech- rokotteen (BNT162b2) kohdan 21 hätäkäyttöluvan.

Pfizer – BioNTech -rokote

1. huhtikuuta 2021 Etelä -Afrikan rokotekokeessa julkaistussa päivityksessä todettiin, että rokote oli toistaiseksi 100% tehokas (eli rokotetut osallistujat eivät nähneet tapauksia), ja kuusi yhdeksästä infektiosta lumelääkeryhmässä oli beeta -muunnos (rivi B .1.351). Kuitenkin yhdeksän päivää myöhemmin, israelilainen tutkimus osoitti, että variantti oli läsnä jopa ihmisillä, jotka olivat saaneet molemmat rokotteen annokset.

5. toukokuuta 2021 Qatarin kansallisen COVID-19-rokotustutkimusryhmän tulosten yhteenvetokirje osoitti 75%: n tehokkuuden infektioita vastaan, eikä vakavia sairauksia ollut yhtään.

Oxford – AstraZeneca

The Financial Times raportoi 6. helmikuuta 2021, että Etelä-Afrikan Witwatersrandin yliopiston yhdessä Oxfordin yliopiston kanssa tekemän tutkimuksen alustavat tutkimustiedot osoittivat, että Oxford-AstraZeneca COVID-19 -rokotteen (AZD1222) teho on heikentynyt beetavaihtoehtoa vastaan. Tutkimuksen mukaan AZD1222- rokote tarjosi otoksessa 2 000 vain "minimaalisen suojan" kaikissa paitsi vakavimmissa COVID-19- tapauksissa .

Etelä -Afrikan hallitus keskeytti 7. helmikuuta 2021 suunnitellun noin miljoonan rokoteannoksen käyttöönoton tutkiessaan tietoja ja odottamalla neuvoja jatkotoimista. Etelä-Afrikan hallitus peruutti sittemmin rokotteen käytön ja myi tarvikkeet muille Afrikan maille, ja vaihtoi rokotusohjelmansa Janssenin COVID-19-rokotteen käyttöön .

Heinäkuussa 2021, koska beeta -esiintyvyys oli lisääntynyt Ranskassa, Yhdistynyt kuningaskunta - AstraZeneca -rokotteen merkittävä käyttäjä - asetti lisärajoituksia ihmisille, jotka matkustavat Yhdistyneeseen kuningaskuntaan Ranskasta. Kuitenkin esiintyvyys Ranskassa on Intian valtameren alueella La Réunionissa , kuten ranskalainen poliitikko ja lääkäri Veronique Trillet-Lenoir huomautti .

BBIBP-CorV

Muut Afrikan maat ovat aloittaneet BBIBP-CorV : n käyttöönoton Sinopharmista , ja Marokko , Egypti , Seychellit ja Zimbabwe aloittavat massan käyttöönoton. Toistaiseksi rokote on osoittautunut vastustuskykyiseksi beeta -variantille, kuten Zimbabwessa on osoitettu. 2. helmikuuta 2021 esipainettu paperi ilmoitti, että Beta -variantin neutralointitoiminta väheni 1,6 -kertaiseksi.

Moderna

Helmikuussa Moderna ilmoitti, että nykyinen rokote ( mRNA-1273 ) tuotti vain kuudesosan vasta-aineista vasteena Etelä-Afrikan varianttiin verrattuna alkuperäiseen virukseen. He ovat käynnistäneet kokeilun uudesta rokotteesta beeta -variantin torjumiseksi.

Sputnik V

Etelä -Afrikan terveystuotteiden sääntelyviranomainen (SAHPRA) on vahvistanut saaneensa asiakirjat Venäjän Gamaleya -instituutin kehittämästä rokotteesta .

Sputnik V (Gam-COVID-Vac) on yksi kolmesta Covid-rokotteesta maailmanlaajuisesti, ja sen teho on oireellisissa tapauksissa yli 90%. Sen todettiin olevan hieman vähemmän tehokas, mutta se toimi paremmin kuin kilpailijat. [1] Beeta -varianttia vastaan ​​havaittiin kolminkertainen VNA -väheneminen. [2] [3]

CoronaVac

CoronaVac on vielä hyväksyttävä käyttöön Etelä-Afrikkalainen Health Products Authority (SAHPRA). Tähän mennessä Sinovac on tarjonnut toimittaa Etelä -Afrikalle 5 miljoonaa rokoteannosta.

Covaxin

Covaxin on todettu tehokkaaksi beeta -varianttia vastaan, vaikka neutraloituminen vähenee kolminkertaisesti.

CoviVac

CoviVac rokote Tietoja ei ole toimitettu Etelä-Afrikkalainen hallitus vielä.

EpiVacCorona

EpiVacCorona rokote Tietoja ei ole toimitettu Etelä-Afrikkalainen hallitus vielä.

ZF2001

ZF2001 rokote tiedot on parhaillaan toimitetaan Etelä-Afrikkalainen hallitus.

Novavax

NVX-CoV2373 Novavax -rokotetta koskeva tutkimus osoitti 60%: n tehon (HIV-negatiivisille osallistujille) Etelä-Afrikassa verrattuna 90%: n tehoon Isossa- Britanniassa .

ImmunityBio

BioVac instituutti, valtion tukema Etelä-Afrikkalainen rokote yritys, aikoo käyttää paljon se voitti valmistaa coronaviruksen rokotteita . Kanssa tehty sopimus amerikkalaisten perustuu ImmunityBio Inc on meneillään kolmannen vaiheen 1 rokotuskokeet niiden hAd5 rokotteella Yhdysvalloissa ja Etelä-Afrikassa.

ImmunityBio ja BioVac aikovat jakaa rokotteet koko Etelä -Afrikkaan ja Afrikkaan.

Epidemiologia

Tutkijat ja virkamiehet kertoivat, että variantin esiintyvyys oli suurempi nuorten keskuudessa, joilla ei ollut taustalla olevia terveydellisiä sairauksia, ja aiheuttaa useammin vakavia sairauksia kuin muut vaihtoehdot. Etelä-Afrikan terveysosasto ilmoitti myös, että muunnelma saattaa ajaa maan COVID-19-pandemian toista aaltoa , koska muunnelma leviää nopeammin kuin muut aikaisemmat viruksen variantit.

Tilastot

Historia

KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platformin ( KRISP ) johtama genomiikkaryhmä KwaZulu-Natalin yliopistossa löysi uuden variantin. Se paljastettiin koko genomin sekvensoinnilla . Useat tämän suvun genomiset sekvenssit toimitettiin GISAID -sekvenssitietokantaan.

23. joulukuuta, UK terveysministerin Matt Hancock ilmoitti, että kaksi ihmistä, jotka oli matkustanut Etelä-Afrikasta on Britannian tartutettiin Beta variantin (501.V2 variantti). Muunnelma oli havaittu 28. joulukuuta kahdella henkilöllä Sveitsissä ja yhdellä Suomessa . Kanta oli havaittu 29. joulukuuta vierailijalta Etelä -Afrikasta Japaniin ja yhdeltä ulkomaalaiselta matkustajalta Queenslandiin , Australiaan . Muunnelma havaittiin 30. joulukuuta Sambiassa . Se todettiin 31. joulukuuta myös Ranskassa matkustajalta, joka palasi Etelä -Afrikasta. Tämän variantin ensimmäinen tapaus havaittiin 2. tammikuuta 2021 Etelä -Koreassa . Itävalta ilmoitti 4. tammikuuta ensimmäisestä tapauksestaan ​​ja neljästä alfa -variantista . Botswanan tasavallan havaitsi myös heidän ensimmäinen tapaus 4. tammikuuta. Kansantasavalta Kiinan raportoitu ensimmäinen tapaus tämän variantin eteläisessä Guangdongin maakuntaan 6. tammikuuta.

Irlannin tasavalta ilmoitti 8. tammikuuta 2021 havainneensa kolme tapausta, jotka kaikki liittyivät Etelä -Afrikan matkustamiseen. Samana päivänä Brasiliasta raportoitiin COVID-19-tartunnan saaneen naisen uudelleeninfektio uudesta variantista, joka oli ensimmäinen tällainen uusiutumisesta maailmassa. Kanada ilmoitti tämän tapauksen ensimmäisen tapauksen Albertassa 9. tammikuuta, ja Israel ilmoitti neljä tapausta, jotka kaikki tuotiin Etelä -Afrikasta matkustaville ihmisille. Uusi -Seelanti ilmoitti ensimmäisen variantin tästä tapauksesta 10. tammikuuta. Saksa ilmoitti 12. tammikuuta mutaation havaitsemisesta kuudessa eri kodista. Samana päivänä ilmoitettiin, että Yhdistyneessä kuningaskunnassa oli yhteensä 29 tapausta, joista kaksi oli aiemmin raportoitu. Seuraavana päivänä, Belgia raportoitu ensimmäinen tapaus henkilöä Länsi-Flanderi ilman matka historiaan, Israel raportoitu neljä muuta tapausta, ja Taiwan raportoitu ensimmäinen tapaus on Swazimaan isästä 30s, joka oli positiivisen COVID-19 1. tammikuuta .

Saksa havaitsi 14. tammikuuta uuden tapauksen ja seuraavana päivänä Kanada ilmoitti toisen mutaatiotapauksen, joka havaittiin Kanadan Brittiläisen Kolumbian maakunnassa . Saksassa ilmoitettiin uudesta tapauksesta samana päivänä. Tanska ja Réunion ilmoittivat ensimmäisistä tapauksistaan ​​16. tammikuuta, kun Israel löysi vielä neljä tapausta. Israel ilmoitti 17. tammikuuta neljästä uudesta tapauksesta, jolloin tämän variantin tapausten kokonaismäärä oli 20. Alankomaissa ilmoitettiin 18. tammikuuta kahdesta lisätapauksesta, jolloin maan kokonaismäärä oli kolme. Ghana ilmoitti ensimmäisen tapauksensa variantista 19. tammikuuta. 23. tammikuuta Panama havaitsi ensimmäisen tapauksensa kannasta Zimbabwesta peräisin olevalla henkilöllä, joka oli matkustanut Etelä -Afrikasta. Belgia ilmoitti myös 23. tammikuuta vähintään 15 muunnelman tapausta Oostendessa, kun taas kuusi tapausta vahvistettiin Komoreilla. Irlannin tasavalta ilmoitti 26. tammikuuta havainneensa kuusi muuta tapausta. Yhdysvallat ilmoitti ensimmäisistä tapauksistaan ​​variantista 28. tammikuuta 2021 Etelä -Carolinan osavaltiossa . Israel ilmoitti 27. tammikuuta vielä 3 tapausta, jotka olivat ensimmäiset muunnelman tapaukset yhteisöstä satunnaisesti kerätyistä näytteistä tietämättä tartunnan lähdettä. Afrikan CDC: n 29. tammikuuta ilmoittamat alustavat tiedot osoittivat, että muunnelma oli saavuttanut Ghanan . Israel ilmoitti 31. tammikuuta ensimmäisestä tapauksestaan, kun Turkista palannut mies tarttui uuteen varianttiin .

1. helmikuuta 2021 Yhdistyneen kuningaskunnan terveys- ja sosiaalihuoltoministeri ilmoitti satunnaisesti 11 muunnelman tapauksesta, joissa ei ollut yhteyttä kansainväliseen matkustamiseen. Samana päivänä Kanadan Ontarion maakunta ilmoitti ensimmäisen variantin tapauksesta Peelin alueella , jossa ei ollut samanlaista matkahistoriaa eikä yhteyttä kenenkään äskettäin ulkomailla olleen kanssa. Irlannin tasavalta ilmoitti 8. helmikuuta kahden muun tapauksen havaitsemisesta.

Itävalta havaitsi 8. helmikuuta 2021 tähän mennessä suurimman beeta -variantin Euroopassa. Yhteensä 293 vahvistettua tapausta ja 200 epäiltyä tapausta on tunnistettu sekvensoinnin avulla, joista suurin osa vahvistetaan suurella todennäköisyydellä. Kaikki tapaukset löydettiin Tirolin alueelta, jossa lähes 9% positiivisista PCR -testeistä tunnistettiin beta -variantiksi sekvensoimalla. Aktiivisten tapausten arvioitiin olevan noin 140. Viikon kestäneen julkisen keskustelun ja poliittisen painostuksen jälkeen Tirolin mahdollisesta karanteenista Itävallan hallitus pidättäytyi eristämästä huolestuttavia alueita, vaan esitti muodollisen vetoomuksen liikkuvuuden vähentämiseksi alueelta ja sieltä pois. alueella ja mene testaamaan Tirolin vierailun jälkeen. Tirolean virkamiehet ilmoittivat aikovansa keventää Tirolin lukitussääntöjä muun Itävallan mukaisesti.

Israelin terveysministeriö totesi 22. helmikuuta, että variantti oli geneettisesti sekvensoitu vain alle prosentissa 3 000 yhteisön näytteestä. Myöhemmin Israel ilmoitti yhteensä 444 tapauksesta, mikä on korkein tartuntatapa maailmassa Etelä -Afrikan ulkopuolella. Irlannin tasavalta ilmoitti 25. helmikuuta neljän muun tapauksen havaitsemisesta. Helmikuun loppuun mennessä Turkissa oli 49 Beta -varianttia.

Filippiinit vahvistivat 3. maaliskuuta 2021 ensimmäiset kuusi uutta tapaustaan ​​Etelä -Afrikkalaisesta variantista, joista kolme Pasayn potilasta ilman matkahistoriaa ja kolme Qatarin ja Arabiemiirikuntien matkahistoriaa . Romania ilmoitti 5. maaliskuuta 2021 kahdesta ensimmäisestä tapauksestaan ​​Etelä -Afrikan variantista, jotka olivat peräisin kahdesta Bukarestin ja Piteștin potilaasta .

Liettua vahvisti 23. maaliskuuta 2021 kaksi ensimmäistä uutta tapaustaan ​​Etelä -Afrikan kannasta, yhden Kaunasin läänissä ja yhden Vilnassa . Epäiltyjä tapauksia on vielä kymmenen. Tartunnan saaneet ihmiset sanoivat, että he eivät matkustaneet minnekään. 26. maaliskuuta vahvistettiin vielä 3 tapausta, mikä tarkoittaa, että virus leviää onnistuneesti sisälle.

Malesia havaitsi 1. huhtikuuta 2021 ensimmäiset tapauksensa Etelä -Afrikan variantista. Terveysministeriö ilmoitti kahdesta tapauksesta, joiden uskotaan olevan peräisin Jalan Lima -klusterista, mukaan lukien Kuala Lumpurin kansainväliselle lentokentälle (KLIA) sijoittautunut työntekijä , ja muita raportoituja tapauksia havaittiin harvoin Selangorissa . Huhtikuun 1. päivänä raportoitiin yhteensä yhdeksän muunnelmaan liittyvää tapausta. Toukokuun loppuun mennessä yhteensä 48 tapausta on havaittu vähintään viidessä klusterissa ja kontaktien jäljittämisessä, joista 20 löydettiin kahdesta Perakin ja Kelantanin klusterista .

12. huhtikuuta 2021 Turkissa oli 285 tapausta 11 maakunnassa.

Katso myös

Huomautuksia

Viitteet

Ulkoiset linkit

• PANGO -suvut: Uusi muunnosraportti - Raportti sukujen maailmanlaajuisesta jakautumisesta B.1.351
• COG-UK-raportti kiinnostavista SARS-CoV-2-piikkimutaatioista Yhdistyneessä kuningaskunnassa