ABL (geeni) - ABL (gene)

ABL1
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE	Ortologihaku : PDBe RCSB
Luettelo ATE -tunnuskoodeista
	1AB2 , 1AWO , 1BBZ , 1JU5 , 1OPL , 1ZZP , 2ABL , 2E2B , 2FO0 , 2G1T , 2G2F , 2G2H , 2G2I , 2GQG , 2HIW , 2HYY , 2HZ0 , 2HZ4 , 2HZI , 2V7A , 3CS9 , 3EG0 , 3EG1 , 3EG2 , 3EG3 , 3EGU , 3K2M , 3QRI , 3QRJ , 3QRK , 3T04 , 3UE4 , 3UYO , 3PYY , 4J9B , 4J9C , 4J9D , 4J9E , 4J9F , 4J9G , 4J9H , 4J9I , 4JJB , 4JJC , 4JJD , 4TWP , 4WA9 , 4XEY , 4YC8 , 5DC9 , 5DC4 , 5DC0 , 2O88 , 5HU9
Tunnisteet
Aliakset	ABL1 , ABL proto-onkogeeni 1, ei-reseptorityrosiinikinaasi, ABL, JTK7, bcr/abl, c-ABL, c-p150, v-abl, CHDSKM, BCR-ABL, Geenit, abl
Ulkoiset tunnukset	OMIM : 189980 MGI : 87859 HomoloGene : 3783 GeneCards : ABL1
EY -numero	2.7.10.2
Geenin sijainti ( ihminen )
Chr.	Kromosomi 9 (ihminen)
Loppu	130 887 675 bp
Geenin sijainti ( hiiri )
Chr.	Kromosomi 2 (hiiri)
Loppu	31,804,227 bp
RNA: n ilmentymisen kuvio
	Lisää viittausilmoitustietoja
Geenien ontologia
Molekyylitoiminta	• aktiinimonomeerin sitoutuminen ; • proteiinidomeenispesifinen sitoutuminen ; • SH3-domeenin sitoutuminen ; • kinaasiaktiivisuus ; • proteiinin C-terminaalinen sitoutuminen ; • signalointireseptorin sitoutuminen ; • ATP-sitoutuminen ; • proteiinikinaasiaktiivisuus ; • nikotinaattinukleotidiadenylyylitransferaasiaktiivisuus ; • kalvon ulkopuolinen proteiinityrosiinikinaasiaktiivisuus ; • metalli ionin sitominen ; • proliinipitoisen alueen sitominen ; • magnesium-ionin sitoutuminen ; • transferaasiaktiivisuus ; • aktiinifilamenttisitoutuminen ; • GO: 0001948 proteiinin sitoutuminen ; • syntaksiinin sitoutuminen ; • proteiinikinaasi C: n sitoutuminen ; • DNA: n sitoutuminen ; • nukleotidisidos ; • mangaani-ionin sitoutuminen ; • mitogeenin aktivoima proteiinikinaasin sitoutuminen ; • proteiinityrosiinikinaasiaktiivisuus ; • nelisuuntainen risteys-DNA: n sitoutuminen ; • kupla-DNA: n sitominen ; • fosfotyrosiinitähteen sitoutuminen ; • GO: 0001105 transkription koaktivaattoriaktiivisuus ; • neuropiliinisidos ; • SH2-domeenin sitoutuminen ; • efriinireseptorin sitoutuminen ; • superkelattu DNA-sitoutuminen ; • sekvenssispesifinen kaksijuosteinen DNA sitova;
Solukomponentti	• sytoplasmassa ; • sytosoliin ; • tumakalvon ; • kalvo ; • ulkoisen komponentin sytoplasmisella puolella solukalvon ; • mitokondrion ; • aktiinisytoskeletonin ; • perinukleaarisella alueella sytoplasman ; • solun tukirangan ; • ydin ; • nucleolus ; • nucleoplasm ; • solu etureuna ; • ydin- kehon ; • dendriitin ; • proteiineja sisältävä monimutkainen ; • hermosolun runko ; • postsynapsi;
Biologinen prosessi	• proteiinin fosforylaation positiivinen säätely ; • B-1 B-solun homeostaasi ; • aksonin pidentymisen säätely ; • hermo-lihaksiprosessi, joka hallitsee tasapainoa ; • lihassolujen erilaistumisen positiivinen säätely ; • soluvaste DNA-vaurioärsykkeelle ; • proteiinin fosforylaatio ; • solun adheesion säätely ; • soluproteiinin muuntamisprosessi ; • mikrotubulusten polymeroitumisen säätely ; • DNA-vaurioiden aiheuttama proteiinin fosforylaatio ; • luontainen apoptoottinen signalointireitti vastauksena DNA-vaurioihin ; • ERK1- ja ERK2-kaskadin positiivinen säätely ; • substraatin tarttumisesta riippuvainen solujen leviäminen ; • verihiutaleista johdettu kasvutekijäreseptori-beeta-signalointireitti ; • positiivinen säätely aktiinifilamenttien sitoutumisesta ; • B-solureseptorin signalointireitti ; • apoptoottinen prosessi ; • endoteelisolujen apoptoottisen prosessin negatiivinen säätely ; • pikkuaivojen morfogeneesi ; • aktiinin sytoskeletonin uudelleenorganisoinnin säätely ; • transkription säätely, DNA-malline ; • epidermaalisen kasvutekijän reseptorin signalointireitti ; • Fc-gam ma-reseptorin signalointireitti osallistuu fagosytoosiin ; • proteiinin lokalisoinnin luominen ; • kateenkorvan kehitys ; • fosfolipaasi C -aktiivisuuden negatiivinen säätely ; • mitoottisen solusyklin positiivinen säätely ; • aktiinifilamentin haarautuminen ; • pernan kehitys ; • vaste oksidatiiviselle stressille ; • fagosytoosi ; • peptidyylityrosiinin positiivinen säätely fosforylaatio ; • säätely vasteena DNA-vauriolle ärsyke ; • mitokondriaalisen depolarisaation ; • positiivinen Wnt-signalointireitin, tasomainen napaisuus polku ; • verihiutaleista peräisin olevan kasvutekijän reseptori-signalointireitin ; • asetukseksi endosytoosin ; • proteiinikinaasi C: n aktiivisuus ; • asetukseksi aktiinisytoskeletonin organisaation ; • fosforylaatio ; • signaalinsiirto vastauksena DNA-vaurioihin ; • oksidoreduktaasiaktiivisuuden positiivinen säätely ; • positiivinen säätely erittyneen kalsiumionin vapautumisesta sytosoliin ; • I-kappaB-kinaasin/NF-kappaB-signaloinnin negatiivinen säätely ; • solujen liikkuvuuden säätely ; • positiivinen säätely mikrotubulusten sitoutuminen ; • soluadheesiot ; • autofagian säätely ; • peptidyylityrosiinin autofosforylaatio ; • alfa-beeta-T-solujen erilaistuminen ; • solun vanhenemisen säätely ; • negatiivinen proteiini-seriini/treoniinikinaasiaktiivisuuden säätely ; • aktiinin sytoskeleton-organisaatio ; • solun vanhenemisen negatiivinen säätely ; • positiivinen säätely osteoblastien lisääntyminen ; • GO: 0007067 mitoottinen solusykli ; • aktivoitu T-solujen lisääntyminen ; • endosytoosi ; • negatiivinen solu-soluadheesion säätely ; • immuunivasteeseen liittyvä B-solujen lisääntyminen ; • soluvaste dopamiinille ; • sytosolisen kalsiumionipitoisuuden positiivinen säätely ; • hermosolun positiivinen säätely kuolema ; • solusyklin säätely ; • BMP-signalointireitin negatiivinen säätely ; • autofagia ; • B-solujen lisääntyminen ; • ubikvitiini-proteiinitransferaasiaktiivisuuden negatiivinen säätely ; • mikrospiikkikokoonpano ; • apoptoottisen prosessin positiivinen säätely ; • solunulkoisen matriisin organisoinnin säätely ; • I-kappaB: n positiivinen säätely sukulaiset ase/NF-kappaB-signalointi ; • ERK1- ja ERK2-kaskadin negatiivinen säätely ; • yhden vaiheen B-solujen erilaistuminen ; • epäsopivuuden korjaus ; • Bergmannin gliasolujen erilaistuminen ; • peptidyylityrosiinifosforylaatio ; • vakuuden itäminen ; • soluvaste lipopolysakkaridille ; • mitoottisen solusyklin negatiivinen säätely ; • soluvaste vetyperoksidille ; • DNA: n korjaus ; • synnynnäinen immuunivaste ; • hermoputken sulkeminen ; • alkion jälkeinen kehitys ; • hermosolujen erilaistuminen ; • soluvaste hapetusstressille ; • solupopulaation lisääntymisen säätely ; • proteiinien autofosforylaatio ; • neuroepiteliaalisten solujen erilaistuminen ; • integriinivälitteinen signalointireitti ; • endoteelisolujen migraation positiivinen säätely ; • solujen erilaistuminen ; • Cdc42 -proteiinisignaalin siirton säätely ; • neuropiliinin signalointireitti ; • endoteelisolujen migraatio ; • T -solujen erilaistumisen säätely ; • positiivinen transkription säätely RNA -polymeraasi II: lla ; • T -solureseptorin signalointireitti ; • positiivinen r stressikuitukokoonpanon egulointi ; • fokaalisen adheesiokokoonpanon positiivinen säätely ; • DNA-konformaation muutos ; • positiivinen solujen siirtymisen säätely, joka liittyy itämiseen angiogeneesiin ; • substraatin tarttumisesta riippuvan solun leviämisen positiivinen säätely ; • negatiivinen säätely pitkäaikaisesta synaptisesta potentiaalista ; • hematopoieettisen varren säätely solujen erilaistuminen ; • synaptisen rakenteen muutoksen säätely ; • verisuonten haarautumisen positiivinen säätely ; • aktiinin sytoskeletonin uudelleenjärjestelyn positiivinen säätely;
	Lähteet: Amigo / QuickGO
Ortologit
	25
	11350
	ENSG00000097007
	ENSMUSG00000026842
	P00519
	P00520
	NM_007313 ; NM_005157
	NM_001112703 ; NM_009594 ; NM_001283045 ; NM_001283046 ; NM_001283047
	NP_005148 ; NP_009297
	NP_001106174 ; NP_001269974 ; NP_001269975 ; NP_001269976 ; NP_033724
	Wikidata
Näytä/muokkaa ihmistä	Näytä/muokkaa hiirtä

Tyrosiiniproteiinikinaasi ABL1, joka tunnetaan myös nimellä ABL1, on proteiini, jota ihmisillä koodaa kromosomissa 9 sijaitseva ABL1- geeni (edellinen symboli ABL ) . c-Abl: tä käytetään joskus viittaamaan nisäkkään genomista löydetyn geeniversion, kun taas v-Abl viittaa virusgeeniin, joka alun perin eristettiin hiiren Abelsonin leukemiaviruksesta .

Toiminto

ABL1 proto-onkogeenin koodaa soluliman ja nukleaarinen proteiini tyrosiinikinaasi , joka on osallisena prosesseja solujen erilaistumista, solun jakautumista , soluadheesion ja stressin vasteen, kuten DNA-korjauksen . ABL1 -proteiinin aktiivisuutta säätelee negatiivisesti sen SH3 -domeeni , ja SH3 -domeenin poistaminen muuttaa ABL1: n onkogeeniksi . T (9; 22) translokaatio johtaa head-to-tail fuusio on BCR ja ABL1 geenejä, mikä johtaa fuusio geenin läsnä monissa tapauksissa krooninen myelooinen leukemia . Kaikkialla esiintyvän ABL1 -tyrosiinikinaasin DNA -sitoutumisaktiivisuutta säätelee CDC2 -välitteinen fosforylaatio , mikä viittaa ABL1 -solusyklin toimintaan. ABL1 geeni ilmentyy joko 6- tai 7-kb: n mRNA-transkripti, jossa on vaihtoehtoisesti liitettyjä ensimmäistä eksonia saumattu yhteisen eksonit 2-11.

Lääketieteellinen merkitys

ABL1-kinaasidomeeni (sininen) kompleksissa toisen sukupolven Bcr-Abl-tyrosiinikinaasin estäjän nilotinibin kanssa (punainen)

ABL1 -geenin mutaatiot liittyvät krooniseen myelooiseen leukemiaan (CML). KML, geeni aktivoidaan parhaillaan translokoituu sisällä BCR (katkaisupiste klusteri alue) geeni kromosomissa 22. Tämä uusi fuusio geeni, BCR-ABL , koodaa säätelemätön, sytoplasma-kohdennettuja tyrosiinikinaasin, joka mahdollistaa solujen proliferatiiviset ilman säädellään mukaan sytokiinit . Tämä puolestaan sallii solun tulla syöväksi .

Tämä geeni on fuusiogeenin kumppani Philadelphian kromosomissa olevan BCR -geenin kanssa , ominainen poikkeavuus kroonisessa myelooisessa leukemiassa (CML) ja harvoin joissakin muissa leukemian muodoissa. BCR-ABL-transkripti koodaa tyrosiinikinaasia , joka aktivoi solusyklisäätelyjärjestelmän välittäjiä , mikä johtaa klonaaliseen myeloproliferatiiviseen häiriöön . BCR-ABL-proteiini voidaan estää useilla pienillä molekyyleillä. Yksi tällainen estäjä on imatinibimesylaatti , joka vie tyrosiinikinaasidomeenin ja estää BCR-ABL: n vaikutusta solusykliin . Toisen sukupolven BCR-ABL-tyrosiinikinaasi-inhibiittoreita kehitetään myös estämään imatinibille vastustuskykyisiä BCR-ABL-mutantteja.

Vuorovaikutukset

ABL -geenin on osoitettu olevan vuorovaikutuksessa :

ABI1 ,
ABI2 ,
ABL2 ,
Pankkiautomaatti ,
BCAR1 ,
BCR ,
BRCA1 ,
Kissa ,
CBL ,
CRKL ,
DOK1 ,
EPHB2 ,
GPX1 ,
GRB10 ,
MTOR ,
GRB2 ,
MDM2 ,
NCK1 ,
NEDD9 ,
NTRK1 ,
P73 ,
PAG1 ,
PAK2 ,
PSTPIP1 ,
RAD9A ,
RAD51 ,
RB1 ,
RFX1 ,
RYBP ,
SHC1 ,
SORBS2 ,
SPTA1 ,
SPTAN1 ,
TERF1 ,
VAV1 ja
YTHDC1 .

Säätö

On joitakin todisteita siitä, että Abl: n ilmentymistä säätelee mikroRNA miR-203 .

Katso myös

BCR -geeni

Viitteet

Lue lisää

Shore SK, Tantravahi RV, Reddy EP (joulukuu 2002). "V-Abl-tyrosiinikinaasin aktivoimat muunnosreitit" . Onkogeeni . 21 (56): 8568-76. doi : 10.1038/sj.onc.1206084 . PMID 12476303 .
Shaul Y (2000). "c-Abl: aktivointi ja ydinkohteet" . Solukuolema eroaa . 7 (1): 10–6. doi : 10.1038/sj.cdd.4400626 . PMID 10713716 .
Era T (2002). "Bcr-Abl on" molekyylikytkin ", joka päättää hematopoieettisten kantasolujen kasvusta ja erilaistumisesta". Int. J. Hematol . 76 (1): 35–43. doi : 10.1007/BF02982716 . PMID 12138893 . S2CID 10269867 .
Pendergast AM (2002). "Abl -perheen kinaasit: säätely- ja signalointimekanismit". Edistyminen syöpätutkimuksessa, osa 85 . Adv. Cancer Res . Edistyminen syöpätutkimuksessa. 85 . s. 51–100. doi : 10.1016/S0065-230X (02) 85003-5 . ISBN 978-0120066858. PMID 12374288 .
Keung YK, Beaty M, Steward W, Jackle B, Pettnati M (2002). "Krooninen myelosyyttinen leukemia, johon liittyy eosinofilia, t (9; 12) (q34; p13) ja ETV6-ABL-geenin uudelleenjärjestely: tapauskertomus ja kirjallisuuskatsaus". Syöpä Genet. Cytogenet . 138 (2): 139–42. doi : 10.1016/S0165-4608 (02) 00609-X . PMID 12505259 .
Saglio G, Cilloni D (2004). "Abl: onkogeenisten fuusioproteiinien prototyyppi". Solu. Mol. Life Sci . 61 (23): 2897–911. doi : 10.1007/s00018-004-4271-0 . PMID 15583852 . S2CID 35998018 .
Shaul Y, Ben-Yehoyada M (2005). "C-Abl: n rooli DNA-vaurion stressivasteessa" . Cell Res . 15 (1): 33–5. doi : 10.1038/sj.cr.7290261 . PMID 15686624 .
Yoshida K (2007). "Määräys Abl -tyrosiinikinaasin ydinkohdistukselle vastauksena DNA -vaurioihin" . Molekulaarisen onkologian edistysaskeleet . Adv. Exp. Med. Biol . Kokeellisen lääketieteen ja biologian edistysaskeleet. 604 . Springer. s. 155–65 . doi : 10.1007/978-0-387-69116-9_15 . ISBN 978-0-387-69114-5. PMID 17695727 .

Ulkoiset linkit

Geenit,+abl US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
Online Mendelin perintö ihmisessä (OMIM): 189980 (ABL)
Abelson+leukemia+virus Yhdysvaltain kansallisen kirjaston lääketieteellisissä aihealueissa (MeSH)
Drosophila Abl tyrosiinikinaasi - The Interactive Fly
ABL1 -tiedot ja linkit Cell Migration Gateway -sovelluksessa
ABL1 on Atlas genetiikan ja onkologian
Ihmisen ABL1 -genomin sijainti ja ABL1 -geenin tietosivu UCSC -genomiselaimessa .
Katsaus kaikkiin rakenteellisiin tietoihin, jotka ovat saatavilla ATE : ssä UniProtille : P00519 (ihmisen tyrosiiniproteiinikinaasi ABL1) PDBe-KB: ssä .
Yleiskatsaus kaikista ATE : ssä saatavilla olevista rakenteellisista tiedoista UniProt : P00520 : lle (hiiren tyrosiiniproteiinikinaasi ABL1) PDBe-KB: ssä .

Languages

In other projects